在經(jīng)過(guò)前兩天對(duì)TGF-β信號(hào)通路的介紹以及現(xiàn)有生信文章的匯總講解后,可能大家還有疑惑是否真的值得研究、那么今天小編就給大家介紹我的TGF-β信號(hào)通路經(jīng)典純生信思路實(shí)戰(zhàn)分析。
5+ TGF-β經(jīng)典思路分析(主要步驟)
Section1: 分析TGF-β信號(hào)通路基因的表達(dá)異常以及在癌型中的預(yù)后能力
Section2: TGF-β表達(dá)模式的研究
Section3: TGF-β不同表達(dá)模式在免疫浸潤(rùn)、免疫檢查點(diǎn)表達(dá)、癌癥發(fā)生發(fā)展中的差異
Section4: 二次聚類
Section5: 構(gòu)建TGF-β預(yù)后signature對(duì)癌癥預(yù)后進(jìn)行分層,結(jié)合臨床特征評(píng)估預(yù)后獨(dú)立性
Section6: TGF-β預(yù)后signature的外部獨(dú)立數(shù)據(jù)集驗(yàn)證
Section7: TGF-β預(yù)后signature風(fēng)險(xiǎn)分組間免疫檢查點(diǎn)和TME細(xì)胞浸潤(rùn)比例差異
Section8: TGF-β預(yù)后signature對(duì)免疫治療效應(yīng)的評(píng)估
從以上小編分析的結(jié)果不難看出,TGF-β預(yù)后signature 5+經(jīng)典的純生信分析無(wú)疑是成功的,小編只是找了TCGA中三十多種癌型中的一種來(lái)測(cè)試就得到了喜人成果。那么其它癌型是否值得一測(cè)呢。
對(duì)個(gè)性化的非個(gè)性化的
TGF-β思路感興趣的小伙伴
掃碼都可以聯(lián)系我們