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哈嘍，小伙伴們，作為科研人的你，是不是還在為想不出新的idea苦苦思索，是不是還在為高分文章而頻頻脫發(fā)。今天，小編為大家介紹一個(gè)具有發(fā)表高分文章潛力的研究熱點(diǎn)——趨化因子，走過路過不要錯(cuò)過，快來瞅瞅吶！
小編主要從以下三個(gè)方面介紹：
1、什么是趨化因子
2、趨化因子與腫瘤具有什么關(guān)系
3、為何利用生物信息分析趨化因子
什么是趨化因子？
趨化因子是一組低分子量（約8~12kDa）的細(xì)胞因子，調(diào)節(jié)免疫細(xì)胞的運(yùn)輸與分化，是免疫系統(tǒng)功能行使的核心?；谄渲饕鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)的前兩個(gè)半胱氨酸殘基的位置，可分為4個(gè)不同的亞家族：C、CC、CXC、CX3C?；谄涔δ埽煞譃閮?nèi)穩(wěn)態(tài)趨化因子和炎癥趨化因子。
主要功能
器官發(fā)育：在器官發(fā)育和血管生成過程中引導(dǎo)干細(xì)胞遷移到適當(dāng)?shù)奈恢?；介?dǎo)細(xì)胞增殖；介導(dǎo)淋巴細(xì)胞的成熟。
免疫監(jiān)視：介導(dǎo)免疫細(xì)胞在健康外周組織中的穩(wěn)態(tài)，維持免疫耐受。
組織更新再生：引導(dǎo)干細(xì)胞和祖細(xì)胞遷移，以促進(jìn)損傷后的組織更新或再生；促進(jìn)愈合過程中的血管生成；促進(jìn)上皮、內(nèi)皮、間充質(zhì)的愈合。
宿主防御：促進(jìn)先天免疫細(xì)胞募集至感染部位，防止微生物傳播；調(diào)節(jié)適應(yīng)性免疫反應(yīng)，包括免疫激活和免疫記憶；調(diào)控效應(yīng)細(xì)胞功能和在外周組織的存活。
趨化因子與腫瘤具有什么關(guān)系？
多數(shù)研究已經(jīng)確定趨化因子及其同源趨化因子受體在癌癥進(jìn)展和治療結(jié)果中發(fā)揮作用，參與腫瘤生長(zhǎng)、存活、腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移和血管生成。今年發(fā)表在Science Immunology上的一篇文章CXCL9 and CXCL10 bring the heat to tumors（IF 30+）重點(diǎn)介紹了趨化因子CXCL9和CXCL10與腫瘤的關(guān)系，文章表示促進(jìn)免疫細(xì)胞向腫瘤募集的一個(gè)主要因素是趨化因子的產(chǎn)生，CXCL9和CXCL10的產(chǎn)生是T細(xì)胞浸潤(rùn)的一個(gè)重要組成部分，可激發(fā)趨化因子網(wǎng)絡(luò)和“熱”腫瘤微環(huán)境。因此，促進(jìn)產(chǎn)生這些趨化因子的髓細(xì)胞的招募的治療干預(yù)措施，以及觸發(fā)產(chǎn)生這些趨化因子的先天免疫途徑激活因子，有可能在臨床中廣泛擴(kuò)大免疫治療的療效。
為何利用生物信息分析趨化因子？
Pubmed檢索“chemokines”，近10年有67001篇文章，其中review 7830篇，文章數(shù)量是逐年上升的（圖1）。Pubmed檢索“(chemokines) AND (bioinformatics)”，近10年僅有2774篇文章，文章數(shù)量也是逐年上升的（圖1）?？梢?，利用生物信息分析趨化因子是很有價(jià)值的。
關(guān)注趨化因子研究的小伙伴們機(jī)會(huì)來了~
在不同類型的趨化因子中，CXC趨化因子在腫瘤發(fā)生中的作用最為顯著。剛剛簡(jiǎn)單的為大家介紹了趨化因子與腫瘤的關(guān)系，那么怎么利用生物信息分析趨化因子呢？小編找到了一篇趨化因子的生信綜合分析文章，最適合大家參考。文章于今年4月發(fā)表于BMC Medical Genomics雜志（IF：3.622）。
研究背景
胰導(dǎo)管腺癌(PDAC)是一種高致死率的惡性腫瘤，占胰腺癌的85%以上。2020年，癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示，與胰腺癌相關(guān)的新增病例為60430例，死亡病例為48220例。在過去的十年中，在晚期疾病的診斷和治療方面取得的進(jìn)展只在患者預(yù)后方面取得了有限的增量進(jìn)展。患者生存時(shí)間未明顯延長(zhǎng)，預(yù)后較差，5年生存率低于10%。這些數(shù)據(jù)說明迫切需要對(duì)PDAC進(jìn)行創(chuàng)新治療。
CXC家族的趨化因子(CXCL1-CXCL17)是小的(8~10 kDa)分泌蛋白，對(duì)炎癥和抗腫瘤免疫至關(guān)重要。結(jié)直腸癌的研究表明，腫瘤微環(huán)境（TME）中的趨化因子經(jīng)常發(fā)生改變，從而影響腫瘤的增殖和轉(zhuǎn)移。李煜等人系統(tǒng)分析了結(jié)直腸癌中CXC趨化因子的表達(dá)及預(yù)后價(jià)值，發(fā)現(xiàn)CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5和CXCL8的表達(dá)增加，提示它們可作為潛在的治療靶點(diǎn)和預(yù)后因素，并參與抗腫瘤免疫應(yīng)答。研究還表明，CXC趨化因子可導(dǎo)致癌癥的促進(jìn)或抑制，這主要取決于抑制或刺激免疫系統(tǒng)作用的能力。然而，PDAC中CXC趨化因子的作用尚未闡明。因此，在本研究中分析了CXC趨化因子家族的mRNA表達(dá)及其與PDAC特征的相關(guān)性。進(jìn)一步闡明了胰腺癌TME中CXC趨化因子與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的相關(guān)性，提高PDAC患者的治療方案和預(yù)后的準(zhǔn)確性，為PDAC的預(yù)后生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)提供更多的數(shù)據(jù)。
研究方法
1、表達(dá)分析
2、生存分析
3、基因突變，共表達(dá)和相互作用分析
4、癌癥相關(guān)途徑及藥物敏感性分析
5、富集分析
6、免疫浸潤(rùn)分析
7、免疫檢查點(diǎn)相關(guān)性分析
研究結(jié)果：
1、 PDAC中CXC趨化因子表達(dá)
2、CXC趨化因子在PDAC中的預(yù)后價(jià)值
3、PDAC中CXC趨化因子的基因改變、共表達(dá)、相互作用分析、癌癥相關(guān)途徑及藥敏分析
4、PDAC中CXC趨化因子的富集分析
5、PDAC中CXC趨化因子免疫浸潤(rùn)分析、免疫檢查點(diǎn)的相關(guān)性分析
總結(jié)：
文章通過對(duì)PDAC中CXC趨化因子的表達(dá)分析、生存分析、基因突變、共表達(dá)和相互作用分析、癌癥相關(guān)途徑和藥物敏感性分析、富集分析、免疫浸潤(rùn)分析和免疫檢查點(diǎn)分析，為CXC趨化因子的表達(dá)及其在PDAC免疫微環(huán)境中的作用提供了新的見解，為PDAC的預(yù)后生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)提供更多的數(shù)據(jù)。
那么趨化因子在其它癌癥中的免疫微環(huán)境中是否也發(fā)揮作用呢？答案是肯定的。另外，趨化因子在其它人類疾病中同樣起到重要作用，例如HIV感染、心血管疾病等。生物信息結(jié)合趨化因子的文章立意及創(chuàng)新思路是具有挖掘價(jià)值的，有想法的小伙伴們快快行動(dòng)起來吧！
