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但凡問出這個問題的人，都是最近被帶節(jié)奏帶的不輕。
其實我本來不想公開說這個話題的，畢竟自己也是做生物信息個性化服務的，直接出來站臺不合適，偷偷的做做項目挺好。
本身技術出身的就最笨，再這樣下去，估計得被卷死。
我直接說觀點：好發(fā)，而且會一直是發(fā)文利器。
大家先別抬杠，先聽我說。什么叫做純生信，就是利用計算機來對各種組學數(shù)據(jù)，包括轉(zhuǎn)錄組，基因組，表觀，蛋白等各種分析，得到一些標記，signature或者模型，然后利用其他的隊列驗證，或者實驗驗證，或者對接基礎做機制研究的。
從組學數(shù)據(jù)出發(fā)到篩選出生物標志物，這一系列過程叫做純生信，之所以純，是因為沒有實驗。
這一系列的過程，大佬都是這么做的，CNS級別的文章很多，十分以上，沒有任何問題。
Integrative Single-Cell Analysis Reveals Transcriptional and Epigenetic Regulatory Features of Clear Cell Renal Cell Carcinoma Cancer Research（IF:13.312）
那為什么大家都說純生信不行了。
其實這里的純生信，大概率是說的公開數(shù)據(jù)庫純生信挖掘。說白了就是跟meta分析一樣，沒有一點自己的數(shù)據(jù)，純粹挖掘別人的，沒有新意，沒有數(shù)據(jù)，純流水線。這樣的純生信不好發(fā)。
首先為什么要用公開數(shù)據(jù)庫，不用自己的數(shù)據(jù)呢。兩個原因，第一個自己沒有數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)信息不完備，甚至說沒有樣本。不用考慮測序的問題，測序現(xiàn)在成本超級低，構建一個自己的隊列沒有任何成本。要知道收集一個具有挖掘價值的隊列是需要很久的時間的，這個時間不是每個小微醫(yī)生都能承受的。說白了，不是不想，是沒有。
第二個問題為什么說公開數(shù)據(jù)庫挖掘沒有前途了，小編認為這個就是個偽命題。如果你的科學問題足夠有意義，編輯不會在乎你用的是誰的數(shù)據(jù)的，這也就是說meta分析還存在，甚至有高分的根本原因。
單細胞大佬張澤民，公開數(shù)據(jù)庫純生信做的腫瘤免疫
公開數(shù)據(jù)庫純生信不好做的原因在于，你沒有好的科學問題，你的科學問題沒有數(shù)據(jù)支持。
而不是說好不好做。
這是兩個概念。
插個廣告，生信人團隊目前有大量的成熟的技術挖掘路線，能設計更貼合臨床的分析思路，已經(jīng)累計服務400+單位，有無數(shù)據(jù)都可以，歡迎找我們課題合作。
二維碼
如果你有好的科學問題，然后你還能匹配各種資源，那就能發(fā)高分文章，順利或者坎坷。
如果你沒有好的科學問題，也沒有什么資源，那就直接臨床問題+公開數(shù)據(jù)庫純生信+簡單實驗驗證，先上車再說。
Identification and Validation of a Prognostic Model Based on Three MVI-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma（Int J Biol Sci , IF 10.75)
別人怎么說不重要，小編目前遇到的分析需求很多，所以你懂得。
