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小編昨天剛預(yù)測接下來會有失巢凋亡的生信文章出來，本來計(jì)劃過幾天再去搜索一下相關(guān)文章，但是直覺告訴我“你現(xiàn)在找找吧，你調(diào)研一下說不定就有新文章出現(xiàn)”。結(jié)果，不找不知道，一找嚇一跳（還是小編直覺準(zhǔn)啊，希望下次買彩票的時(shí)候能靈光乍現(xiàn)）
有篇預(yù)后模型的生信文章已被Frontiers in Genetics（IF:4.772）接受，（小編上次說了預(yù)后模型是比較快且好發(fā)的文章）激動的心，顫抖的手，小編我站起來跟您講。
雖然還沒有正式發(fā)表，但是這東西你能等嗎，這可是“一個(gè)蘿卜一個(gè)坑”，它是有時(shí)效性的（啊不然拿什么講“創(chuàng)新點(diǎn)“）小編必須立馬分享給大家，不然就真的晚了。
背景
HNSCC是世界上第六大最常見的癌癥，也是頭頸部最常見的惡性腫瘤。
失巢凋亡是一種程序性細(xì)胞死亡的形式，它對腫瘤細(xì)胞從細(xì)胞外基質(zhì)中獲得分離后的存活至關(guān)重要。在侵襲性腫瘤細(xì)胞中產(chǎn)生的失巢凋亡抗性已被確定為腫瘤進(jìn)展的關(guān)鍵因素，但是很少有研究關(guān)注在頭頸鱗癌失巢凋亡與轉(zhuǎn)移之間的關(guān)系。
于是作者探討了失巢凋亡相關(guān)基因在頭頸鱗癌中的預(yù)后價(jià)值，并進(jìn)一步探討失巢凋亡相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)評分組間患者腫瘤微環(huán)境的差異。
結(jié)果
與預(yù)后相關(guān)的失巢凋亡相關(guān)基因（ANRG）的識別
ANRG獲?。簭腉eneCard和Harmonizome共獲得358個(gè)失巢凋亡相關(guān)基因。（注意是相關(guān)基因，不是失巢凋亡“嫡系”基因哦，不要問為什么，小編也不知道）
使用單基因cox獲得33個(gè)與預(yù)后相關(guān)的基因，并對這33個(gè)基因進(jìn)行刻畫（圖1），其中有24個(gè)與較差的預(yù)后顯著相關(guān)。
圖1
利用33個(gè)ANRG對HNSCC分子亞群進(jìn)行一致性聚類
該HNSCC隊(duì)列可很好地被分為三個(gè)亞型，總體生存分析顯示，3種亞型之間的預(yù)后有顯著性差異。ANRGs表達(dá)熱圖及三個(gè)亞型的臨床病理特征表明LTF基因可能是預(yù)后良好的因素，并對三個(gè)亞型間不同的功能富集途徑進(jìn)行探索（圖2）。
圖2
三種亞型中的基因表達(dá)和免疫浸潤
用箱線圖顯示了三組亞群中ANRG的表達(dá)差異，由于與總生存率相關(guān)，這些差異基因可能是影響HNSCC患者預(yù)后的關(guān)鍵分子以及靶向治療的潛在靶點(diǎn)（圖3A）。此外，免疫細(xì)胞浸潤水平也有顯著性差異（圖3B），亞型B中激活的CD4、CD8和B淋巴細(xì)胞的比例明顯低于其他兩種亞型的。
圖3
預(yù)后signature構(gòu)建和驗(yàn)證
失巢凋亡相關(guān)預(yù)后signature展示出良好的預(yù)測效能（圖4）。
圖4
不同風(fēng)險(xiǎn)評分組的GSEA和免疫活性
探索在高、低風(fēng)險(xiǎn)得分組中的腫瘤微環(huán)境（TME）景觀（圖5）。
圖5
建立HNSCC患者預(yù)后列線圖
圖6
ANRG與TME的相關(guān)性分析
使用單細(xì)胞數(shù)據(jù)集分析TME中7個(gè)ANRGs的表達(dá)情況（圖7）。
圖7
藥物敏感性分析
圖8
總之，基于失巢凋亡相關(guān)基因構(gòu)建了一個(gè)預(yù)后模型能夠很好地預(yù)測HNSCC患者的生存率，對與這一模型相關(guān)的分子機(jī)制的研究。
當(dāng)小編看完這篇文章的時(shí)候，整體感覺就是，怨種啊/（ㄒoㄒ）/~~，明明比去年同水平的文章卷，分析過程掉的頭發(fā)應(yīng)該也不比同類型8分的文章少，這至少是個(gè)5的水平才對！（小編就是這么耿直，不接受爛菜葉子臭雞蛋哈哈）
由于還沒有正式發(fā)表，所以對于獲取到的內(nèi)容中一些細(xì)節(jié)，小編認(rèn)為還是值得再完善的。但這并不妨礙我們繼續(xù)做失巢凋亡相關(guān)的研究，因?yàn)橐粋€(gè)科學(xué)問題可以有多種解讀方式。
已經(jīng)發(fā)表的文章方向，大家是都能看到的，小編把它們總結(jié)歸納之后預(yù)測失巢凋亡會是下一個(gè)熱點(diǎn)或者說已經(jīng)悄悄變成熱點(diǎn)了，現(xiàn)在看來小編說的沒錯。趁它進(jìn)入大眾視線之前，已經(jīng)有人在行動了，不要等太久。
