“新三年舊三年,縫縫補(bǔ)補(bǔ)又三年”,血小板可真是忙了一年又一年。作為“抗洪”主力軍出身的血小板,遇到癌癥之后技能表可謂是年年刷新年年新。
今天小編給大家分享2篇血小板相關(guān)的文章,內(nèi)容和影響因子真的平易又近人。
第一篇
一組血小板相關(guān)循環(huán)長鏈非編碼RNA作為結(jié)直腸癌的潛在生物標(biāo)志物
IF=5.736
摘要
有證據(jù)表明,受腫瘤誘導(dǎo)的血小板(TEPs)有可能成為癌癥診斷的生物標(biāo)志物庫,但分離的難度限制了它的應(yīng)用。由于大多數(shù)循環(huán)RNA來自于血小板,血小板中RNA譜系的改變可能導(dǎo)致血清中RNA表達(dá)的改變。在本研究中,作者確定了一個(gè)血小板相關(guān)的長非編碼RNAs(lncRNAs)小組,并評(píng)估了其在結(jié)直腸癌(CRC)患者血清中的診斷能力,為CRC診斷的血液檢測清單增加了新的lncRNA生物標(biāo)志物,并為CRC血小板和血清之間的通信提供了分子證據(jù)。
背景
CRC是第三大常見惡性腫瘤,盡管由于不同的生活方式和飲食特征,CRC的發(fā)病率在全球范圍內(nèi)有所不同,但新診斷的CRC的上升趨勢在不同地區(qū)表現(xiàn)出相似性。先前的研究發(fā)現(xiàn),通過糞便免疫化學(xué)試驗(yàn)(FITs)、結(jié)腸鏡篩查、愈創(chuàng)木酚基糞便潛血試驗(yàn)(gFOBT)和乙狀結(jié)腸鏡檢查(柔性乙狀結(jié)腸鏡檢查)篩查的患者的結(jié)直腸癌死亡率顯著降低。然而,由于價(jià)格高、耗時(shí)長或感染和腸穿孔風(fēng)險(xiǎn)高,這些篩查方法的廣泛應(yīng)用受到限制。最近的研究致力于開發(fā)新的可用于常規(guī)患者監(jiān)測的血液診斷生物標(biāo)記物。最近的證據(jù)表明,lncRNA生物標(biāo)記物可以更好地動(dòng)態(tài)檢測癌癥狀態(tài),尤其是在血液中。
在本研究中,作者旨在評(píng)估大腸癌患者血清中TEP衍生的lncRNAs的表達(dá),并構(gòu)建具有顯著lncRNAs的診斷模型,以研究其在區(qū)分大腸癌患者中的準(zhǔn)確性。此外,我們評(píng)估了這些循環(huán)lncRNAs與病理特征之間的相關(guān)性,以探索診斷性lncRNAs的潛在病因機(jī)制。
研究設(shè)計(jì)如圖1所示,本研究包括三個(gè)獨(dú)立的數(shù)據(jù)集:發(fā)現(xiàn)集、訓(xùn)練集和個(gè)體驗(yàn)證集。
結(jié)果
腫瘤培養(yǎng)血小板中調(diào)控異常的lncRNAs的鑒定
圖2 CRC患者和健康對(duì)照血小板中的lncRNA表達(dá)譜。A. PCA分析圖顯示了沿PC1和PC2的所有54個(gè)樣本。B.對(duì)ANOVA定義的128個(gè)差異表達(dá)基因進(jìn)行分層聚類。C和D.火山圖(C)和MA圖(D)說明了lncRNA配置文件中數(shù)據(jù)的分布
研究人群的特征
診斷循環(huán)lncRNAs的建模和評(píng)估
圖3訓(xùn)練集中CRC患者和健康對(duì)照血清樣本中4種lncRNA的表達(dá)水平和診斷價(jià)值。A.與健康對(duì)照相比,CRC患者血清中的LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1上調(diào)。B.通過 ROC 分析計(jì)算訓(xùn)練集中診斷組的AUC和用于診斷CRC的各個(gè)lncRNA組件的AUC。C.訓(xùn)練集中構(gòu)建的循環(huán)lncRNAs判別模型的參數(shù)
基于4種lncRNAs模型的驗(yàn)證
圖4基于4-lncRNAs的模型在驗(yàn)證集中CRC患者和健康對(duì)照的血清樣本中的診斷性能。A.與健康對(duì)照相比,CRC患者血清中的LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1上調(diào)。 B通過ROC分析計(jì)算診斷組的AUC和驗(yàn)證集中用于診斷CRC的單個(gè)lncRNA組件的AUC
lncRNAs與臨床病理特征的相關(guān)性
討論
血清中的RNA表達(dá)水平在很大程度上取決于TEPs。該研究發(fā)現(xiàn),4種lncRNAs(LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1)在大腸癌患者的TEP和血清中均存在失調(diào),具有一致的變異特征。這一觀察結(jié)果表明了這4個(gè)lncRNAs在大腸癌發(fā)生中的病因?qū)W價(jià)值,并為闡明TEPs與癌細(xì)胞通過血液相互作用提供了新的分子證據(jù)。
(這篇文章發(fā)了5分,不信也得信?。?/p>
第二篇
PDGFRA作為年輕結(jié)直腸癌患者治療靶點(diǎn)的作用
IF=5.531
摘要
由于早期診斷和治療的困難,年輕的結(jié)直腸癌(CRC)患者與老年患者相比表現(xiàn)出較差的預(yù)后。然而,其潛在的分子特征仍不清楚。作者利用全外顯子組和RNA測序?qū)?9名無遺傳性CRC患者的腫瘤和匹配的正常樣本進(jìn)行了全面分析。作者的研究表明,年輕患者的CRC與CMS4(Consensus molecular subtype 4)和血小板衍生生長因子受體α(PDGFRA)有關(guān)。此外,PDGFRA可能服務(wù)于新型治療策略的潛力,并代表年輕CRC患者對(duì)瑞戈非尼反應(yīng)的預(yù)測性生物標(biāo)志物。
背景
在結(jié)直腸癌患者中,除遺傳性癌癥綜合征外,一些早發(fā)結(jié)直腸癌是由遺傳性基因突變引起的?;蚪M和轉(zhuǎn)錄組水平的比較分析將為年輕大腸癌的分子機(jī)制提供更多細(xì)節(jié)和見解。最近,提出了一種更詳細(xì)的基于基因表達(dá)的大腸癌分類,包括以下四種生物學(xué)上不同的一致分子亞型(CMS)[19]:CMS1(微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)和免疫激活)、CMS2(上皮型和標(biāo)記的WNT信號(hào))、CMS3(上皮型和代謝失調(diào)),和CMS4(間充質(zhì)型和活化TGF-β信號(hào))。CMS4的臨床相關(guān)性與不良預(yù)后相關(guān),而其他的預(yù)后相對(duì)較好,對(duì)單個(gè)CMS組的分類對(duì)于推進(jìn)CRC患者的精確醫(yī)學(xué)具有巨大潛力。
在這項(xiàng)研究中,作者對(duì)49例大腸癌患者進(jìn)行了綜合分析,通過腫瘤和匹配的正常樣本的全外顯子組和RNA測序來了解年輕患者的分子特征。為了識(shí)別年輕大腸癌患者的特異性生物標(biāo)志物,作者將樣本分為三組:年輕組(<40歲)、中年組(41-60歲)和老年組(>60歲)。這三組的比較可以區(qū)分年輕和老年大腸癌,并揭示更清晰的分子亞型和基因組改變。該研究提供了對(duì)年輕大腸癌和新生物標(biāo)志物的深入了解。
結(jié)果
根據(jù)結(jié)直腸癌患者年齡的CMS分類
年輕和老年大腸癌的mRNA差異表達(dá)和基因譜分析
圖2年輕結(jié)直腸癌和老結(jié)直腸癌組織之間的差異mRNA表達(dá)和基因分析。a 差異表達(dá)基因的火山圖。b年輕和老年組之間差異表達(dá)基因的維恩圖。c所選基因表達(dá)譜的熱圖。d來自表達(dá)中顯著改變的基因的豐富途徑。e CRC相關(guān)突變(錯(cuò)義、無義和剪接)的Oncoprint。f樣本中經(jīng)常檢測到的拷貝數(shù)擴(kuò)增和缺失
年輕CRC患者中高水平的PDGFRA表達(dá)
圖3 PDGFRA在年輕和老年CRC患者中的表達(dá)。a PDGFRA mRNA表達(dá)和年齡的散點(diǎn)圖。b年輕CRC組和老年CRC組中PDGFRA表達(dá)水平之間的箱線圖。c CMS4患者中PDGFRA表達(dá)水平的比較。d按年齡組劃分的三個(gè)類別的 CMS 類型餅圖(上圖),以及年輕 CRC 組和老年CRC組中PDGFRA表達(dá)水平之間的箱線圖(下圖)
PDGFRA與CMS4相關(guān)因子的共表達(dá)
圖4 EMT和血管生成因子的共表達(dá)。a PDGFRA和EMT相關(guān)特征之間的基因表達(dá)水平散點(diǎn)圖。b PDGFRA和血管生成相關(guān)特征之間的基因表達(dá)水平散點(diǎn)圖。每個(gè)點(diǎn)代表一個(gè)根據(jù)CMS類型著色的樣本。密度圖顯示年輕組和老年組的表達(dá)水平比較
患者來源的細(xì)胞(PDC)中PDGFRA的表達(dá)和PDGFRA靶向藥物反應(yīng)
圖5 PDC中PDGFRA表達(dá)和PDGFRA靶向藥物反應(yīng)。a年輕和年老PDC中 PDGFRA表達(dá)水平(RT-qPCR)之間的箱線圖。b年輕和年老PDC中PDGFRA的蛋白質(zhì)印跡。c通過敲低年輕患者PDC中PDGFRA的活力。d通過敲除老年患者PDC中PDGFRA的活力。e PDC對(duì)regorafenib的敏感性。所有用于PDC的患者術(shù)前均未接受任何治療
討論
從轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)中,作者發(fā)現(xiàn)與CMS4相關(guān)的PDGFRA在年輕大腸癌患者中明顯高于老年大腸癌患者。當(dāng)PDGFRA被siRNA下調(diào)時(shí),年輕患者PDC的增殖率明顯低于老年P(guān)DC。年輕的CRC特異性通路包括PDGFRA信號(hào)傳導(dǎo)、通過VEGF激活的PDGF受體信號(hào)傳導(dǎo)對(duì)細(xì)胞增殖的正向調(diào)節(jié)、細(xì)胞趨化性、趨化性調(diào)節(jié)、PLC活性的正向調(diào)節(jié)和磷脂酰肌醇磷酸化。這些結(jié)果表明PDGFRA可能是年輕大腸癌患者的一個(gè)生物標(biāo)志物,并且可能在CMS4相關(guān)通路中發(fā)揮關(guān)鍵作用。年輕大腸癌患者的CMS分類可以更好地告知臨床醫(yī)生新治療策略的預(yù)后和潛力。該研究數(shù)據(jù)顯示,雷戈拉非尼對(duì)PDGFRA上調(diào)的年輕大腸癌的PDC更敏感,可能是治療年輕大腸癌患者的潛在候選藥物。
無論多少,只要有益于醫(yī)藥衛(wèi)生事業(yè)的發(fā)展,那就“人間值得”~
加油血小板!加油科研!