在當(dāng)前背景下,科研能力和學(xué)術(shù)水平可以體現(xiàn)出一所醫(yī)(學(xué))院的社會(huì)地位。雖然已經(jīng)有人提出應(yīng)當(dāng)破除“唯SCI論”的觀點(diǎn)。但是根據(jù)當(dāng)前的大環(huán)境來看,這種觀點(diǎn)一時(shí)半會(huì)還不能被大眾接受。所以說一個(gè)不做科研、沒有文章的醫(yī)生會(huì)降低自己的競(jìng)爭(zhēng)力。而想要有一篇屬于自己的SCI文章,首先得有一個(gè)好的科研思路。我相信大家每當(dāng)提到科研思路,都會(huì)有點(diǎn)苦惱,尤其是碰到放養(yǎng)型導(dǎo)師時(shí),尤為明顯。在這里,我為大家介紹一下一個(gè)優(yōu)秀的科研思路是如何誕生的。
老生常談讀文獻(xiàn)
相信你每次去詢問導(dǎo)師關(guān)于科研的問題,導(dǎo)師最后總是親切的回復(fù)你一句:多讀文獻(xiàn)(自己學(xué))。那為什么我們要去讀文獻(xiàn)呢?一開始我讀文獻(xiàn)的原因可能是因?yàn)閯e人都這么做吧,因?yàn)樵谖覀冎車尼t(yī)生、博導(dǎo)、碩導(dǎo)、同門師兄弟們,全部需要在科研論文研究過程中讀大量文獻(xiàn)。但是經(jīng)過幾年的磨練,我發(fā)現(xiàn)事情沒那么簡(jiǎn)單。
首先對(duì)于我們來說,想要去做科研,得先知道我們所研究領(lǐng)域的現(xiàn)狀怎么樣??次墨I(xiàn)就是最直接有效的辦法。所研究領(lǐng)域的現(xiàn)狀主要集中在綜述、基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的Introduction和discussion部分。讀完這三部分后,就對(duì)整個(gè)領(lǐng)域有一個(gè)大體的認(rèn)識(shí)。除此之外,在剛邁進(jìn)科研領(lǐng)域的大門時(shí),研究方法,主要是實(shí)驗(yàn)方法成為我們科研路上的絆腳石。但是通過閱讀文獻(xiàn),我們可以知道哪些實(shí)驗(yàn)是比較常見的、做這些實(shí)驗(yàn)的目的和意義是什么。當(dāng)我們獲得這些知識(shí)時(shí),可以說是半只腳踏過科研的門檻。最后我想談?wù)劵A(chǔ)實(shí)驗(yàn)中的result部分。這個(gè)部分可以說是整篇文章的靈魂了,其目的是為了呈現(xiàn)研究的主要結(jié)果。結(jié)果部分反映了論文的水平和價(jià)值,也是我們獲得科研思路的重要來源。對(duì)于科研老手來講,可能只需要看這一部分就夠了。
總之,大量閱讀文獻(xiàn)是碩士乃至博士開啟科研之旅的必經(jīng)之路。雖然,讀文獻(xiàn)的過程枯燥、難懂,讓人真的很難讀下去,并且大家經(jīng)常會(huì)讀到后面就忘了前面講的是什么。但是我們?nèi)砸獔?jiān)持下去。
基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的科研思路如何誕生?
現(xiàn)代科研的基本模式是假說驅(qū)動(dòng)的,而科研假說主要滿足科學(xué)性、明確性、邏輯性和創(chuàng)新性。我認(rèn)為其中最重要的就是創(chuàng)新性。以臨床基礎(chǔ)研究為例,其目標(biāo)為尋找疾病的新機(jī)制(關(guān)鍵分子)、藥物新機(jī)理、診療的新策略。通過閱讀了大量的文獻(xiàn),我把科研課題的要素組成提煉為一個(gè)公式:A基因通過調(diào)控B(機(jī)制)在C中(疾病、細(xì)胞、動(dòng)物模型)發(fā)揮D作用??梢钥闯鲆话愕目蒲姓n題涉及這四要素。但是這四種要素并不一定會(huì)全部出現(xiàn)在一篇文章中。這么說可能有點(diǎn)抽象,我舉幾個(gè)例子。
這兩個(gè)例子是我挑出來的,題目比較明顯。在這兩篇文章題目中[1, 2]就充分的體現(xiàn)了文章的四要素:第一篇文章是在2019年發(fā)表的,GATA3(A基因)通過抑制Slug(B機(jī)制)增加肝細(xì)胞癌C中(疾病、細(xì)胞、動(dòng)物模型)的侵襲性(D發(fā)揮作用)。表達(dá)第二篇文章是2021年11月發(fā)表的,在乳腺癌C中(疾病、細(xì)胞、動(dòng)物模型)中,GATA3(A基因)通過結(jié)合下游BRCA1(B機(jī)制)抑制EMT(D發(fā)揮作用)。通過兩篇文章,我們不難發(fā)現(xiàn)兩者的相似之處。這也就引出創(chuàng)造科研思路或者課題的第一種辦法:貍貓換太子。像上面兩個(gè)例子。作者利用的是同種關(guān)鍵分子GATA3。按照總結(jié)的公式來講。后者將肝細(xì)胞癌的研究轉(zhuǎn)戰(zhàn)到自己研究的乳腺癌中。并且對(duì)于新的機(jī)制進(jìn)行了探索,至于后面的研究該怎么展開,只需做相應(yīng)的預(yù)實(shí)驗(yàn)就可以了。這種提出新的科研思路的方法是最普遍的,因?yàn)樯鲜龅腁、B、C、D四種都是可以換的。這時(shí),可能會(huì)有人可能會(huì)問一個(gè)關(guān)鍵問題:這樣還算創(chuàng)新嗎?明確的告訴你:算!而且這種方法簡(jiǎn)單易上手,大家都在用。
不知道大家在閱讀文獻(xiàn)的討論部分時(shí)會(huì)不會(huì)看到這樣的一句話:由于XX機(jī)制尚不明確,需要對(duì)XX進(jìn)行進(jìn)一步研究。其實(shí),作者的這句話往往就暗示了另一種科研思路。在公式中,往往體現(xiàn)出缺少B機(jī)制的要素。下面我來給大家介紹第二種方法,探索尚未發(fā)現(xiàn)的機(jī)制。挖掘尚未發(fā)現(xiàn)的機(jī)制機(jī)理對(duì)科研人員有一個(gè)比較高的要求,不僅要對(duì)這個(gè)領(lǐng)域比較重要的科學(xué)技術(shù)問題了如指掌,還要對(duì)這個(gè)領(lǐng)域所有新進(jìn)展保持敏感性。結(jié)合自己的問題,可能會(huì)發(fā)現(xiàn)很多、很棒的思路。我們還拿GATA3舉例。
這篇文章[3]發(fā)表在很早的年份2004年,作者在對(duì)人類乳腺腫瘤的基因芯片分析中,發(fā)現(xiàn)無論是正常乳腺腔上皮還是雌激素受體(ESR1)陽(yáng)性的腫瘤都顯示出GATA3的高表達(dá)。然后作者經(jīng)過一系列的實(shí)驗(yàn)證明:GATA3參與了上皮細(xì)胞的生長(zhǎng)控制和分化狀態(tài)的維持,GATA3變異可能會(huì)導(dǎo)致ESR1陽(yáng)性乳腺腫瘤的發(fā)生。從這篇文章中就不難總結(jié)出幾個(gè)科研思路。第一,GATA3通過什么樣的機(jī)制參與了上皮細(xì)胞的生長(zhǎng)控制和分化狀態(tài)的維持?第二,既然是上皮細(xì)胞的生長(zhǎng)控制和分化狀態(tài),那么其他的腫瘤呢?第三,GATA3對(duì)具體腫瘤發(fā)生,腫瘤微環(huán)境,腫瘤遷移等等有什么樣的影響?這樣幾個(gè)有創(chuàng)意的科研思路不就有了嗎?
就是這么簡(jiǎn)單,在2004年的那篇文章過去九年之后,2013就出現(xiàn)了這篇《在乳腺癌中發(fā)現(xiàn)的 GATA3 突變可能與異常的核定位、減少的反式激活和細(xì)胞侵襲性有關(guān)》的文章,探索了其發(fā)生作用的可能機(jī)制。
所以說閱讀一篇文章,要思考這篇文章有沒有可以深入或者拓展的地方,這樣就會(huì)獲得一個(gè)屬于自己的idea。當(dāng)然也得考慮自己idea的可行性。這就需要和導(dǎo)師商量了,因?yàn)樗浅鲥X的那個(gè)呀。當(dāng)然最好可以咨詢專業(yè)大佬的意見。
既然開始搞科研了,不能只憑著熱情。做某個(gè)項(xiàng)目前就把大局觀培養(yǎng)出來,能夠通過多個(gè)角度去看待問題。最后為大家介紹這種獲得科研思路的方式是最正統(tǒng)和最有意義的。那就是在臨床和科研中,你切實(shí)發(fā)現(xiàn)了某種問題,并且想去解決。提出了這樣一個(gè)假設(shè)后,需要去閱讀大量文獻(xiàn)去求證自己的想法。在這個(gè)基礎(chǔ)上,你自然有了對(duì)科研思路評(píng)價(jià)的能力。然后要讓自己的想法變得再簡(jiǎn)單一些,靜下心來做不跟風(fēng)、有價(jià)值的研究工作。思路對(duì)了,就一定能做出自己想要的東西。這樣就可以摸索出屬于自己的思路與風(fēng)格??茖W(xué)研究終究是發(fā)現(xiàn)真理的過程!
不想做基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn),或者沒有相應(yīng)的條件怎么辦?
在我們的研究中,回顧性研究也占有一席之地。它是從以往臨床工作積累的病例資料中,選擇某一時(shí)期同類臨床資料進(jìn)行整理、分析,以從中總結(jié)經(jīng)驗(yàn)、找出規(guī)律、指導(dǎo)實(shí)踐的研究。其優(yōu)點(diǎn)就是不需要做實(shí)驗(yàn)。簡(jiǎn)單易上手。其對(duì)應(yīng)的思路也是簡(jiǎn)單粗暴,無非就是以下幾點(diǎn)
另外,近年來生信分析可謂炙手可熱,常規(guī)的生信分析思路,主要包括差異基因的篩選、功能富集分析、基因表達(dá)水平的檢驗(yàn)以及預(yù)后模型的建立和評(píng)估。借助生信的方式,可以助力你的回顧性研究。
寫在最后的話:差點(diǎn)忘記獲得優(yōu)秀科研思路重要的方法,關(guān)注生信人公眾號(hào),每日為您奉獻(xiàn)精品思路哦~
參考文獻(xiàn)
[1] F. Bai, L.H. Zhang, X. Liu, C. Wang, C. Zheng, J. Sun, M. Li, W.G. Zhu, X.H. Pei, GATA3 functions downstream of BRCA1 to suppress EMT in breast cancer, Theranostics, 11 (2021) 8218-8233.
[2] Z. Zhang, X. Fang, G. Xie, J. Zhu, GATA3 is downregulated in HCC and accelerates HCC aggressiveness by transcriptionally inhibiting slug expression, Oncol Lett, 21 (2021) 231.
[3] J. Usary, V. Llaca, G. Karaca, S. Presswala, M. Karaca, X. He, A. Langerod, R. Karesen, D.S. Oh, L.G. Dressler, P.E. Lonning, R.L. Strausberg, S. Chanock, A.L. Borresen-Dale, C.M. Perou, Mutation of GATA3 in human breast tumors, Oncogene, 23 (2004) 7669-7678.