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你可以永遠(yuǎn)相信線粒體熱點(diǎn)
不一樣的線粒體思路：線粒體動(dòng)力學(xué)
國自然中標(biāo)熱點(diǎn)預(yù)測(cè)：線粒體動(dòng)力學(xué)
馬上就到國自然申報(bào)時(shí)間了，小伙伴們手里是否已經(jīng)有準(zhǔn)備好合適的課題打贏這場(chǎng)戰(zhàn)爭？回顧22年國自然中標(biāo)情況，線粒體第三的地位在新的一年里能不能超過巨噬細(xì)胞呢？小編認(rèn)為希望是很大的，原因在于22年里給大家詳細(xì)講述巨噬細(xì)胞方向時(shí)已發(fā)現(xiàn)大量的巨噬細(xì)胞文章，反觀線粒體與疾病之間的串?dāng)_并不像巨噬細(xì)胞那樣被研究那么透徹。
線粒體為細(xì)胞提供能量、并控制氧化還原穩(wěn)態(tài)、致癌信號(hào)、先天免疫和凋亡。事實(shí)上，線粒體的生物過程和質(zhì)量控制在癌癥中經(jīng)常被上調(diào)。幾十年前Warburg觀察到癌癥在氧氣存在的情況下發(fā)酵葡萄糖，這表明線粒體呼吸的缺陷可能是癌癥的潛在原因。所以基于線粒體的研究依然大有可為。
線粒體動(dòng)力學(xué)方向
經(jīng)典與個(gè)性化
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那么今天給大家?guī)淼囊幌盗芯€粒體思路又是怎樣的呢，當(dāng)然我們不能像之前那樣收集一堆不做細(xì)節(jié)方向區(qū)別的線粒體基因無差別的放在一起做分析，這樣的分析已經(jīng)有發(fā)表的文章，那么怎么做才能讓你的線粒體研究更新穎且有意義呢？
我們關(guān)注到，線粒體作為組織內(nèi)穩(wěn)態(tài)必不可少的能量發(fā)生器和程序性凋亡和壞死細(xì)胞死亡的通道，其核心功能使得線粒體的質(zhì)量和數(shù)量需受到嚴(yán)格控制。線粒體的融合、分裂、自噬（線粒體動(dòng)力學(xué)）維持著線粒體正常的形態(tài)、分布、功能和數(shù)量。線粒體的失衡通常與人類各種疾病，包括腫瘤的發(fā)生發(fā)展。所以我們把重點(diǎn)放在線粒體動(dòng)力學(xué)的調(diào)控因子上。
小編看到這個(gè)過程的時(shí)候就在想這與m6A甲基化修飾過程調(diào)控相關(guān)酶：Writers（催化m6A甲基化的發(fā)生）、Erasers（去除m6A甲基化的修飾）和Readers（識(shí)別m6A修飾位點(diǎn)）不是異曲同工嗎？那么是否能把之前m6A的系列做法同樣用到線粒體動(dòng)力學(xué)調(diào)控因子上呢？那么跟著小編看看怎么做吧。
思路一、線粒體動(dòng)力學(xué)相關(guān)signature
當(dāng)我們拿到一個(gè)基因集合的時(shí)候，最基礎(chǔ)的思路就是基于這個(gè)基因集合進(jìn)行篩選，并且構(gòu)建一個(gè)signature。以m6A為例，最簡單的便是構(gòu)建預(yù)后signature。特點(diǎn)是快準(zhǔn)狠，不到1個(gè)月就能輕松做出一個(gè)3-5水平的結(jié)果。
思路二、線粒體動(dòng)力學(xué)相關(guān)疾病分型思路
基于某個(gè)基因集合的分子分型可以很好的關(guān)聯(lián)臨床，同樣是非常經(jīng)典的思路。當(dāng)然與思路一的區(qū)別在于分析內(nèi)容相對(duì)較多，書寫起來相對(duì)難一點(diǎn)。不過如果結(jié)果很好的話，是有機(jī)會(huì)沖高分（m6A 修飾模式研究當(dāng)年可是發(fā)到了MC影響因子40+的水平）。
思路三、單細(xì)胞數(shù)據(jù)出發(fā)或者單細(xì)胞聯(lián)合bulk RNA數(shù)據(jù)研究
單細(xì)胞結(jié)合bulk RNA發(fā)文是當(dāng)前主流，單純的單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘或者聯(lián)合bulk RNA數(shù)據(jù)，能夠輕松做到6+以上水平。只不過與前兩個(gè)比起來，分析難度提升了不少。
思路四、泛癌研究
涉及泛癌的研究影響因子肯定不低，只要基因集合挑得好有新意，連單細(xì)胞都不用加隨隨便便都是8+以上，泛癌分析就是要拼速度，不然別人做了再發(fā)就很尷尬了，審稿人對(duì)這種形式也還是非常愿意接收的。
思路五、非編碼RNA 預(yù)后signature
非編碼RNA其實(shí)都不用多說，因?yàn)檠芯康娜瞬]有那么多競爭沒那么大。唯一需要注意的就是lncRNA的隊(duì)列并不多，不好做驗(yàn)證。
結(jié)語
除了為大家整理的思路之外，想抓住線粒體動(dòng)力學(xué)這個(gè)點(diǎn)，還有非常多的角度（除了癌癥線粒體還與胚胎發(fā)育、腦、心血管等疾病相關(guān)）。隨著現(xiàn)在生信的發(fā)展，很多思路都非常成熟，比的就是誰更快。小編也為了方便大家評(píng)估這個(gè)方向的可行性已經(jīng)整理了線粒體動(dòng)力學(xué)（融合、分裂、自噬）過程的調(diào)控因子并在各個(gè)癌型中做了初步評(píng)估。想要獲取初步分析結(jié)果以及其他經(jīng)典思路和個(gè)性化思路，趕快掃碼上車。
線粒體動(dòng)力學(xué)方向
經(jīng)典與個(gè)性化
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