轉化生長因子-β (TGF-β) 是一種分泌型多功能細胞因子,TGF-β在癌癥中大量表達,與不良臨床結局相關。TGF-β發(fā)揮全身免疫抑制作用并抑制宿主免疫監(jiān)視??蓮娏艺{節(jié)免疫細胞的活性(抑制免疫細胞:CD8+T細胞、NK細胞、M1型巨噬細胞、B細胞;促進免疫抑制細胞:Treg細胞、M2型巨噬細胞)。同時促進皮間質轉化 (EMT)、癌細胞侵襲和遷移、細胞外基質 (ECM) 沉積、血管生成和癌癥相關成纖維細胞形成(CAF)等惡性特征。
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(ref1:35461253/Mol Cancer/IF:27; ref2:20538542/Trends Immunol/IF:16; ref3:33823905/J Hematol Oncol/17; ref4:32710082/Nat Rev Clin Oncol/IF:66)
TGF-β對抗腫瘤免疫的影響(Ref:33823905; 2022;J Hematol Oncol)
因為TGF-β能加劇對眾多免疫細胞功能的抑制,阻止了T細胞向腫瘤中心的滲透,使腫瘤細胞逃脫于免疫監(jiān)視及免疫系統(tǒng)的追擊,導致對免疫治療并不敏感。那么作為免疫治療的新靶點,純生信文章怎么來闡述它與免疫治療的關聯(lián)呢,今天小編就整理了3篇TGF-β與腫瘤免疫以及免疫治療如何關聯(lián)的純生信文章供大家參考。
第一篇:高的TGF-βsignature 可預測婦科癌癥患者的免疫治療耐藥性(基于自測免疫治療的隊列逐步分析發(fā)現(xiàn)TGF-βsignature與免疫治療獲益相關)
主要步驟及結果
分析接受ICI免疫治療婦科腫瘤隊列免疫反應與免疫治療標記物的關聯(lián)
整體的響應免疫治療的marker識別及上游最顯著的調控因子識別(KRAS, ESR1,IGF1, CCN2, THRB, and TGFB1)
基于不同婦科癌種主要響應marker篩選,發(fā)現(xiàn)6個TGF-β信號通路基因表達與免疫治療時的生存獲益相關,并由相關基因構建TGF-βscore,結果表明TGF-βscore低的患者接受免疫治療有顯著改善(整體隊列+卵巢癌隊列)
接下來對免疫浸潤細胞進行了分析以及TGF-β在誘導免疫抑制腫瘤免疫微環(huán)境中的機制
第二篇:構建新的TGF-βsignature預測膀胱癌臨床結局及腫瘤免疫微環(huán)境表型(基于公開的癌型隊列和免疫治療隊列研究TGF-βsignature與免疫表型和免疫治療關聯(lián);非常巧的是與上一篇同一天發(fā)表)
主要步驟及結果
篩選差異的TGF-β基因構建和驗證TGF-βsignature預測OS
結合臨床特征分析TGF-βsignature的獨立預后性能以及構建和驗證整合的列線圖(準確性在 0.8左右)
3、TGF-β signature預測TME表型及免疫治療效果(訓練集及測試集)
4、TGF-β signature預測臨床表型及潛在治療候選藥物(訓練集及測試集)
第三篇:腎透明細胞癌TGF-β信號通路的突變和表達改變的多組學分析(新鮮出爐2022年4.11搶先發(fā)表)
主要步驟及結果
差異的TGF-β信號通路基因差比表達展示和預后能力展示;無監(jiān)督聚類識別腫瘤TGF-β相關亞型,構建預后TGF-βsignature,評估預測效能
TGF-βsignature關聯(lián)腫瘤驅動等關鍵maker基因及基于藥物IC50值預測潛在靶向藥,分析通路基因與TME細胞相關型和免疫治療響應狀況
構建TGF-βsignature并在獨立數(shù)據(jù)集中進行驗證、獨立預后分析以及列線圖構建
TGF-β信號通路的泛癌研究
小結:
對于TGF-β信號通路純生信的分析到這就結束了,全網(wǎng)小編也只找到了3篇相關的純生信文章??梢钥吹讲徽撌亲詼y數(shù)據(jù)還是公共數(shù)據(jù)出發(fā)研究者們都發(fā)現(xiàn)了TGF-β信號通路與腫瘤免疫狀態(tài)顯著相關,并且通過構建TGF-βsignature也能對免疫治療或非免疫治療隊列的生存進行預測。這個與我們最初的觀點是自洽的。小編還初步探索了其它癌型預后跟TGF-β信號通路的相關性(下圖),初步結果可見研究TGF-β信號通路的科研意義。
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