空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)是什么?
一個組織標(biāo)本,在病理學(xué)家的眼中,腫瘤,基質(zhì),免疫細(xì)胞都可以被輕松的鑒定,空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)相當(dāng)于在獲得了這些信息的基礎(chǔ)上,同時獲取細(xì)胞/通路的空間位置和對應(yīng)的表達(dá)信息。借此,可以通過分析,將細(xì)胞,基因表達(dá)和通路相關(guān)聯(lián),在探索組織學(xué)特征的同時,還能繼續(xù)探索分子機(jī)制。
空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用:
范圍:腫瘤;免疫;器官發(fā)育;神經(jīng);病理
方向:闡明組織的細(xì)胞類型組成;細(xì)胞相互作用分析;闡明組織成分之間的分子相互作用;
空間轉(zhuǎn)錄組的一般分析思路:
空間轉(zhuǎn)錄組的經(jīng)典分析內(nèi)容
空間轉(zhuǎn)錄組的研究方向(包括文章舉例)
腫瘤細(xì)胞發(fā)育分化以及腫瘤亞結(jié)構(gòu)的認(rèn)知
“從癌前病變發(fā)展到晚期疾病的動態(tài)的細(xì)胞、形態(tài)和分子特征。”
“腫瘤的轉(zhuǎn)移播散、復(fù)發(fā)機(jī)制探索”
“免疫、基質(zhì)等細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞的相互作用”
器官發(fā)育分化及其功能重塑
“區(qū)分損傷、修復(fù)和重塑的組織結(jié)構(gòu),以及疾病特異性基因表達(dá)梯度”
“三級淋巴結(jié)構(gòu)發(fā)育分化的動態(tài)機(jī)制”
瘤內(nèi)微生物群對腫瘤的影響