掃碼聯(lián)系客服
十月份發(fā)表在《nature communication》上的一篇關(guān)于神經(jīng)內(nèi)分泌癌（NEC）的研究，根據(jù)神經(jīng)轉(zhuǎn)錄因子ASCL1和NEUROD1的表達(dá)，揭示了兩種不同的NEPC亞型，雖然在細(xì)胞系和人類腫瘤抑制模型（PDX）中，這些亞型是相互排斥的，但對人類臨床樣本的單細(xì)胞分析顯示出更復(fù)雜的腫瘤結(jié)構(gòu)，亞型在同一腫瘤中作為獨(dú)立的亞群共存。這些腫瘤亞群在遺傳和表觀遺傳上的差異導(dǎo)致了人類轉(zhuǎn)移瘤內(nèi)和腫瘤間的異質(zhì)性，這一研究可以有效的為臨床提供更有效地治療策略。
摘要：
神經(jīng)內(nèi)分泌癌(NECs)是一種高級別腫瘤，可發(fā)生在肺、結(jié)腸、前列腺或膀胱等解剖部位。NECs的特點(diǎn)是侵襲性臨床行為和不良預(yù)后。在組織形態(tài)學(xué)上，NEC包括一組具有小細(xì)胞癌特征的腫瘤，并表現(xiàn)出神經(jīng)內(nèi)分泌(NE)標(biāo)志物，包括SYP、CHGA和INSM12的表達(dá)。鑒于這些共同特征，NECs構(gòu)成了獨(dú)特的臨床病理實(shí)體，盡管它們的解剖學(xué)起源不同。從遺傳學(xué)的角度來看，NECs通常以RB1和TP53的基因組的畸變?yōu)樘卣鳌?/p>
默克爾細(xì)胞癌(MCC)：RB1和TP53改變與NEC病因的關(guān)聯(lián)在默克爾細(xì)胞癌(MCC)中得到了證實(shí)。MCC通常是由默克爾細(xì)胞多瘤病毒DNA的克隆整合引起的，這導(dǎo)致病毒T抗原的持續(xù)表達(dá)，干擾RB14 (MCC多瘤病毒陽性)。
胃腸道神經(jīng)內(nèi)分泌癌：胃腸道NEC (GINEC)通常也含有TP53和RB1改變，與分化良好的胃腸道類癌相比，在臨床上具有侵襲性和高增殖性，雖然也顯示神經(jīng)內(nèi)分泌表型，但在臨床上通常是惰性的，與TP53和RB1改變無關(guān)。NEC可以是新生的，也可以是治療壓力的結(jié)果。
小細(xì)胞肺癌：小細(xì)胞肺癌(SCLC)最常發(fā)生在新生階段，但也可在EGFR突變型肺腺癌(AD)治療后出現(xiàn)。根據(jù)基本螺旋-環(huán)-螺旋(bHLH)轉(zhuǎn)錄因子(TFs) ASCL1和NEUROD17的差異表達(dá)，SCLC被進(jìn)一步分類。這些神經(jīng)元譜系的TFs (LTFs)與lung8,9的常駐NE細(xì)胞的成熟有關(guān)。它們也參與了致癌過程，如SCLC小鼠模型所示，其中ASCL1是腫瘤形成所必需的。
神經(jīng)內(nèi)分泌前列腺癌：神經(jīng)內(nèi)分泌前列腺癌(NEPC)最常作為一種治療突發(fā)性表型出現(xiàn)，在前列腺ADs治療后抑制雄激素受體(AR)通路活性，并且很少發(fā)生新生。NEPC預(yù)后差，治療選擇非常有限，目前作為同質(zhì)疾病治療。
在這里，我們展示了一系列NECs的染色質(zhì)譜，并確定收斂到一個(gè)共同的表觀遺傳狀態(tài)。發(fā)現(xiàn)在治療緊急的NEPC中存在與新發(fā)SCLC中所描述的一致的亞型。在相同的人類NEPC標(biāo)本中，這些亞型作為具有不同染色質(zhì)狀態(tài)的獨(dú)立亞群共存。觀察到的臨床NEPC樣本的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性具有治療意義。
結(jié)果：
神經(jīng)內(nèi)分泌癌NECs有一個(gè)共同的DNA可訪問區(qū)域
(FIG1)
在組織形態(tài)學(xué)上，NECs表現(xiàn)出相似之處，這可能是由共同的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子激活引起的。為了研究染色質(zhì)可及性對NEC表型的影響，研究人員利用高通量測序(ATACseq)和RNA測序(RNA-seq)分析在不同解剖位置產(chǎn)生的NECs的表觀遺傳格局，并將其應(yīng)用于患者的NEPC、SCLC和MCC異種移植(PDX)模型，以及GINEC的臨床樣本。由于NEC可以從既存的腺癌中產(chǎn)生，以NEPC為典型，偶爾也有SCLC，我們假設(shè)這些組織學(xué)是腫瘤進(jìn)展譜的極端。為了通過ATAC-seq分析確定神經(jīng)內(nèi)分泌癌和腺癌之間染色質(zhì)狀態(tài)的差異，我們還生成了轉(zhuǎn)移性前列腺癌 (PRAD) PDX模型的數(shù)據(jù)，并使用了癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)用于原發(fā)性PRAD和非小細(xì)胞肺腺癌。對ATAC-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行的無監(jiān)督主成分分析(PCA)顯示，與解剖位點(diǎn)分離的腺癌相比，NECs聚類在一起，表明染色質(zhì)處于收斂狀態(tài)(圖a)。為了驗(yàn)證這一結(jié)果，研究人員還分析了之前發(fā)表的ATAC-seq結(jié)果，這些結(jié)果來自于表達(dá)特定致癌驅(qū)動(dòng)程序集的工程細(xì)胞，這些細(xì)胞將正?；浊傲邢偌?xì)胞重新編程為NE狀態(tài)。數(shù)據(jù)集的ATAC-seq峰的樣本樣本相關(guān)性也支持這樣的結(jié)果，即來自同一組織的NECs彼此之間比它們的腺癌對應(yīng)物更相似(圖b)。為了研究參與NE染色質(zhì)狀態(tài)的表觀遺傳驅(qū)動(dòng)因素，研究人員對腺癌和NECs之間的DNA可及性進(jìn)行了監(jiān)督分析，發(fā)現(xiàn)腺癌和NECs之間的DNA可及性較高，并發(fā)現(xiàn)所有神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤類型共享的特異性可訪問位點(diǎn)(圖c)。在前列腺細(xì)胞中也可以看到nec特異性染色質(zhì)標(biāo)記，在神經(jīng)內(nèi)分泌特異性可達(dá)位點(diǎn)上信號明顯增加，而在腺癌特異性位點(diǎn)上信號很少或沒有。我們還確定了與每個(gè)位點(diǎn)最近的基因，并將ATAC標(biāo)記翻譯成RNA-seq標(biāo)記，發(fā)現(xiàn)我們可以在患者隊(duì)列中區(qū)分去雄抵抗前列腺癌(CRPC)和NEPC，進(jìn)一步驗(yàn)證了PDX模型的簽名。
通過基因組區(qū)域富集注釋工具(GREAT)分析，將基因組區(qū)域與附近的基因關(guān)聯(lián)起來，然后檢測基因本體(GO)路徑的富集，進(jìn)一步研究了腺癌和NECs之間染色質(zhì)組織的主要差異。神經(jīng)內(nèi)分泌特異性dna可達(dá)區(qū)域附近的基因在神經(jīng)分化、發(fā)育、形態(tài)和軸突發(fā)生的通路上顯著富集(圖1d)。接下來，研究人員使用HOMER研究了富集TF dna結(jié)合基板的特異性位點(diǎn)。該分析顯示，bHLH TF家族的基本基元顯著富集，特別是對ATOH1、ASCL1和NEUROD1，以及對NFIB、SOX2和NKX2-1基元顯著富集(圖e)。而ASCL1和NEUROD1則被認(rèn)為在sclc中具有相應(yīng)的作用。NFIB是一種TF，此前與SCLC22的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)重組有關(guān)，而SOX2和NKX2-1也已知與sclc有關(guān)。研究ATAC-seq峰中哪些基元共同出現(xiàn)，我們觀察到三個(gè)主要基元模塊(ASCL1、ATOH1和NEUROD1)與SOX2或NFIB或兩者同時(shí)出現(xiàn)的情況非常頻繁。通過將神經(jīng)內(nèi)分泌特異性位點(diǎn)與cisstromeDB中已發(fā)表的染色質(zhì)免疫沉淀測序(ChIP-seq)譜進(jìn)行比較，確定了已發(fā)表的結(jié)合位點(diǎn)與GIGGLE評分所量化的神經(jīng)內(nèi)分泌特異性ATAC-seq峰重疊程度最高的TFs。與觀察到的NECs共享表觀遺傳程序一致，頂部重疊的ChIP-seq數(shù)據(jù)集來自SCLC、MCC或神經(jīng)譜系(圖f)。特別是，ASCL1 (SCLC)、NEUROD1 (SCLC和髓母細(xì)胞瘤)和MAX (MCC)的結(jié)合譜與神經(jīng)內(nèi)分泌特異性可及染色質(zhì)重疊評分最高(圖1f)。接下來，研究人員分析了在研究樣本中這些tf和其他nec相關(guān)因子的表達(dá)。正如預(yù)期的那樣，研究人員觀察到NE標(biāo)記(SYP, CHGA和INSM1)和莖干TF SOX2(圖g)在NECs中的表達(dá)有很強(qiáng)的共性。研究人員還觀察到在NEPC和SCLC中包括ASCL1或NEUROD1在內(nèi)的bHLH TFs的更互斥的表達(dá)模式，GI-NECs中ASCL1和ASCL2的表達(dá)，MCC中ATOH1的表達(dá)(圖g)?？偟膩碚f，研究人員的研究結(jié)果表明腫瘤和器官特異性bHLH轉(zhuǎn)錄因子維持著常見的NE表觀遺傳狀態(tài)。
治療后的NEPC可根據(jù)ASCL1和NEUROD1的表達(dá)進(jìn)行細(xì)分
(FIG2)
為了探索轉(zhuǎn)錄因子(TF)調(diào)控NEC表觀遺傳狀態(tài)的異質(zhì)性，研究人員對局限于NECs的ATAC-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行了無監(jiān)督分析。SCLC和NEPC在DNA可及性方面的相似性取決于ASCL1或NEUROD1表達(dá)的狀態(tài)，而不是腫瘤類型。僅在前列腺樣本中對DNA可及性的無監(jiān)督分析(圖a)顯示出與AR(所有神經(jīng)內(nèi)分泌前列腺癌)、ASCL1或NEUROD1表達(dá)相關(guān)的明確聚類分組，通過分析這些相同前列腺樣本的RNA-seq數(shù)據(jù)也可以看出相同的聚類。接下來，我們旨在鑒定與ASCL1和NEUROD1 NEPC亞型相關(guān)的差異DNA。通過監(jiān)督分析比較表達(dá)NEPC的ASCL1和NEUROD1樣本，發(fā)現(xiàn)了8950個(gè)ASCL1-和12751個(gè)NEUROD1-特異性可及區(qū)域(圖b)。接下來，我們調(diào)查了SCLC中的NEPC亞型特異性位點(diǎn)，并在這些tf特異性基因組區(qū)域觀察到類似的染色質(zhì)可及性模式，此外，還發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)狀態(tài)與ASCL1和NEUROD1的差異表達(dá)之間存在關(guān)聯(lián)。值得注意的是，ASCL1和NEUROD1共同表達(dá)的SCLC病例在兩組區(qū)域顯示聯(lián)合可達(dá)性。這一結(jié)果強(qiáng)調(diào)了腫瘤亞型的染色質(zhì)狀態(tài)的驚人相似性，包括SCLC和NEPC。值得注意的是，盡管這兩種亞型在可及性方面存在明顯差異，但鑒于兩種亞型具有共同的NE特征，正如預(yù)期的那樣，這兩種亞型之間仍有大量的開放染色質(zhì)位點(diǎn)共享。
為了進(jìn)一步研究不同亞型間的染色質(zhì)差異，我們研究了TF亞型特異性染色質(zhì)可及性與ASCL1和NEUROD1基因組結(jié)合之間的關(guān)系。差異染色質(zhì)可及位點(diǎn)被相應(yīng)的TF結(jié)合，而不是被另一個(gè)TF結(jié)合(圖b)。這一結(jié)果與ASCL1和NEUROD1在各自亞型中維持染色質(zhì)狀態(tài)的作用一致。接下來，研究人員利用來自相同樣本的表達(dá)數(shù)據(jù)，試圖確認(rèn)針對ASCL1和NEUROD1亞型的增強(qiáng)子與附近基因的表達(dá)相關(guān)(圖c)。正如預(yù)期的那樣，差異表達(dá)分析顯示ASCL1是ASCL1組中上調(diào)最多的基因之一，而相反，NEUROD1組顯示包括NEUROD1/2/4/6在內(nèi)的多個(gè)NEUROD家族成員上調(diào)(圖c)。與這些差異可及區(qū)域的功能一致，觀察到差異DNA可及性和差異基因表達(dá)之間存在顯著關(guān)聯(lián)(圖c)?；蚣患治鲆宰R別兩種亞型中不同程度過度表達(dá)的通路，結(jié)果顯示ASCL1相關(guān)的基因表達(dá)在細(xì)胞因子28反應(yīng)的GO通路中富集，而neurod1相關(guān)的表達(dá)在腦發(fā)育通路中富集(圖d)。在ASCL1亞型中特別富集的是癌胚抗原相關(guān)細(xì)胞粘附分子(CEACAM1,5,6,7)。有趣的是，CEACAM5已經(jīng)被研究使用一種antieacam5 - sn38抗體偶聯(lián)劑靶向NEPC。此外，與NEUROD1亞型相比，ASCL1亞型表現(xiàn)出相對較高的主要組織相容性復(fù)合體i相關(guān)基因(人類白細(xì)胞抗原基因，NLRC5)的表達(dá)，這可能有助于富集與ASCL1相關(guān)的免疫途徑。然而，相對于CRPC中的表達(dá)，其表達(dá)仍然很低。因此，與其他NECs類似，這兩種亞型NEPC均表現(xiàn)出相對較低的抗原提呈途徑表達(dá)。ASCL1和NEUROD1轉(zhuǎn)錄因子與自身啟動(dòng)子和附近增強(qiáng)子的結(jié)合表明，它們在NEPC中作為LTF發(fā)揮作用。已知LTF通過與超級增強(qiáng)子(SEs)結(jié)合建立一個(gè)正反饋循環(huán)來自動(dòng)激活自己的表達(dá)。此外，LTFs形成核心tf的回路，由促進(jìn)維持譜系所需的轉(zhuǎn)錄程序的SEs激活驅(qū)動(dòng)。ASCL1和NEUROD1都是已知的神經(jīng)系統(tǒng)轉(zhuǎn)錄因子。調(diào)查的潛在LTF行為都在NEPC TFs,我們執(zhí)行SE分析由ASCL1 H3K27ac剖析和NEUROD1 NEPCs,并發(fā)現(xiàn)所有的模型顯示,常見的TFs SE激活各種腫瘤亞型(圖e)。此外,我們發(fā)現(xiàn)ASCL1或NEUROD1(以及其他家族成員)的不同SEs與它們的表達(dá)狀態(tài)一致?；谶@些特點(diǎn),ASCL1和NEUROD1都可以被視為LTFs與綁定NEPC SEs并激活自己的表達(dá)式(圖c、f)。接下來，我們使用前面描述的方法識別相互關(guān)聯(lián)的自動(dòng)調(diào)節(jié)回路，識別與兩個(gè)子類型各相關(guān)的tf的核心電路。我們在這兩種亞型中發(fā)現(xiàn)了不同但高度重疊的TF通路(圖g)。綜上所述，我們的結(jié)果為NEPC模型系統(tǒng)中存在兩種分子亞型提供了明確的證據(jù)。這些亞型具有相同的NE表型特征，但ASCL1和NEUROD1的表達(dá)不同，這與不同的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)譜有關(guān)。
NEPC肝轉(zhuǎn)移瘤的異質(zhì)性分析
(FIG3)
接下來，研究人員為了去確定模型系統(tǒng)的結(jié)果是否可以擴(kuò)展到人類臨床NEPC。首先調(diào)查了兩組NEPC轉(zhuǎn)移腫瘤組織中ASCL1和NEUROD1的表達(dá)水平。與之前在NEPC PDXs中觀察到的兩個(gè)TFs相互排斥的表達(dá)相反，臨床樣本顯示了一系列的共表達(dá)。在大多數(shù)轉(zhuǎn)移灶中ASCL1表達(dá)較高，同時(shí)幾乎所有病例中NEUROD1表達(dá)較低且更多變(圖a)。臨床NEPC樣本中TFs的差異表達(dá)與我們比較ASCL1和NEUROD1 NEPC模型中識別的相應(yīng)基因標(biāo)記的富集有關(guān)。
為了研究這些tf是否在相同的腫瘤細(xì)胞或不同的腫瘤亞群中共同表達(dá)，研究人員研究了5個(gè)不同的肝轉(zhuǎn)移(FLMs)片段，這些片段來自于一名確診為NEPC的患者的尸檢，可用最佳切割溫度化合物冷凍和福爾馬林固定石蠟包埋材料，并使用RNAseq來評估ASCL1和NEUROD1的表達(dá)水平。這些水平顯示了兩種TFs的共表達(dá)范圍，其中FLM3顯示了NEUROD1與ASCL1的最高相對表達(dá)。接下來，對FLM3上的ASCL1和NEUROD1蛋白表達(dá)進(jìn)行免疫組化(IHC)分析。ASCL1和NEUROD1染色顯示了腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性，定義了兩個(gè)分離的腫瘤群體，它們存在于腫瘤切片的不同部位(圖b)。這兩種亞型都表現(xiàn)出NE表型，其特征是NE標(biāo)記INSM1的表達(dá)和AR表達(dá)的缺失。與組織形態(tài)學(xué)特征的相關(guān)性表明，兩種不同的細(xì)胞群在組織學(xué)特征上也存在差異。ASCL1陽性細(xì)胞呈片狀生長和梭形細(xì)胞形態(tài)，而neurod1陽性細(xì)胞似乎生長在更小的細(xì)胞簇中，具有明顯的核模塑和局灶多形性巨細(xì)胞(圖c)。研究人員將IF分析擴(kuò)展到另外6個(gè)NEPC樣本，也觀察到存在相同類型的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性，沒有ASCL1和NEUROD1共表達(dá)。
接下來，研究人員通過單細(xì)胞染色質(zhì)(scATAC-seq)和表達(dá)(單核RNA測序(snRNA-seq))分析研究了兩個(gè)觀察到的腫瘤內(nèi)群體。選擇NEUROD1表達(dá)最高的FLM3和表達(dá)最低的FLM5，幾乎是ASCL1的200倍。從FLM3冰凍切片中分離細(xì)胞核，并進(jìn)行scATAC-seq和snRNA-seq，將ASCL1和NEUROD1的表達(dá)與相應(yīng)的染色質(zhì)狀態(tài)聯(lián)系起來。scat -seq的無監(jiān)督t分布隨機(jī)鄰居嵌入(tSNE)聚類生成多個(gè)聚類，分析了在SOX2啟動(dòng)子上的差異可及性，以區(qū)分腫瘤細(xì)胞和正常細(xì)胞。根據(jù)對SOX2的可及性，腫瘤細(xì)胞的比例約為80%。值得注意的是，可以根據(jù)ASCL1和NEUROD1啟動(dòng)子的不同可及性來區(qū)分對應(yīng)于兩種腫瘤亞型的簇。ASCL1和NEUROD1簇在大容量分析確定的最高ATAC差異區(qū)域也顯示出不同的可及性。另外一組由在ASCL1或NEUROD1啟動(dòng)子處顯示可訪問性但混合的細(xì)胞組成;我們將該簇標(biāo)記為混合。接下來，我們分析snRNA-seq以識別表達(dá)ASCL1和NEUROD1的腫瘤細(xì)胞，然后使用SEURAT34將該數(shù)據(jù)集與scATAC-seq整合(圖d)。這種整合可以基于特定標(biāo)記的表達(dá)來分配正常的細(xì)胞。至關(guān)重要的是，從大量數(shù)據(jù)發(fā)展而來的具有ASCL1或NEUROD1可及性特征的細(xì)胞優(yōu)先表達(dá)相應(yīng)的TF(圖d)。結(jié)果表明，ASCL1和NEUROD1亞型作為獨(dú)立的亞群體存在，與它們各自的模型系統(tǒng)中具有相似的表觀遺傳特征。接下來研究人員研究了FLM5樣本，它通過scATAC-seq分析具有最高的ASCL1表達(dá)。根據(jù)RNA-seq, tSNE分析顯示，在ASCL1啟動(dòng)子處有一個(gè)FLM5腫瘤細(xì)胞聚類，但在NEUROD1處沒有。FLM3和FLM5的綜合scATAC分析顯示，99%的FLM5腫瘤細(xì)胞重疊于FLM3 ASCL1簇(圖e)，表明這些細(xì)胞具有相同的染色質(zhì)可及性。接下來，研究人員在圖2a中模型系統(tǒng)定義的PCA空間中繪制FLMs通過TF聚類聚合的scATAC-seq，這進(jìn)一步驗(yàn)證了原代組織中兩個(gè)亞型的染色質(zhì)狀態(tài)(圖f)?？傊@些結(jié)果都表明了，人類NEPC轉(zhuǎn)移的亞型異質(zhì)性，這些亞型顯示出與模型系統(tǒng)中觀察到的相似的明顯表觀遺傳特征。
在患者轉(zhuǎn)移中，NEPC亞型是不同的但仍然相關(guān)的克隆
(FIG4)
接下來，研究人員試圖使用全外顯子組測序(WES)和拷貝數(shù)變異(CNV)從ATAC-seq數(shù)據(jù)來研究NEC樣本的遺傳特征。從大量ATAC-seq數(shù)據(jù)推斷RB1基因狀態(tài)顯示，在所有NEPC PDX模型中均存在雙等位基因缺失，但在腺癌前列腺癌(ADPC)模型中沒有。通過FLM3和FLM5的tSNE分析，將同樣的方法應(yīng)用于全基因組的scat-seq簇。結(jié)果顯示，這些簇的cnv總體上具有相似性(圖a)。例如，在ASCL1和NEUROD1簇中觀察到所有的chr16和部分chr2和chr13雜合子缺失。此外，我們發(fā)現(xiàn)在兩個(gè)簇中，在chr10的PTEN上都有一處雜合子缺失。然而，存在明顯的CNV差異，包括chr14p和chr7p擴(kuò)增20 MB，僅存在于NEUROD1簇。值得注意的是，F(xiàn)LM3中ASCL1成分的CNVs與FLM5中的ASCL1聚類顯示出幾乎相同的特征，而與同一片段內(nèi)的NEUROD1聚類顯示出較低的相關(guān)性(圖b)。雖然FLM樣本來自大塊組織，但WES分析驗(yàn)證了scacc-seq推斷的CNV改變，包括chr14p和chr7p的擴(kuò)增。最后，我們將FLM3的CNV分析擴(kuò)展到單細(xì)胞水平。k值意味著基于CNVs的細(xì)胞聚類區(qū)分了三個(gè)簇:一個(gè)對應(yīng)于正常細(xì)胞，沒有變化，另外兩個(gè)簇顯示變化。另一組細(xì)胞在chr7p和chr14p有擴(kuò)增，與NEUROD1類型相關(guān)，第三組細(xì)胞沒有與ASCL1類型相關(guān)的改變(圖d)。接下來，研究人員在該樣本的scATAC-seq tSNE圖中標(biāo)記來自遺傳分析中定義的三個(gè)集群的細(xì)胞的身份，并顯示出與表觀遺傳分析定義的分組的強(qiáng)烈對應(yīng)(圖e)。重要的是，這種單細(xì)胞分析加強(qiáng)了對scATACseq分析中識別的混合聚類的解釋，表明它對應(yīng)于混合的ASCL1和NEUROD1克隆，而不是一個(gè)獨(dú)立的克隆。結(jié)果顯示，在該患者中存在與兩個(gè)NEPC表觀遺傳亞型相關(guān)的不同遺傳克隆，考慮到它們的大量CNV譜重疊，可能來自一個(gè)共同祖先。
文章小結(jié)：
簡單的四張圖，從存在于多種癌癥的神經(jīng)內(nèi)分泌腺癌中發(fā)現(xiàn)了兩種基因作為標(biāo)簽的兩種亞群，再根據(jù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證和單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析去進(jìn)一步研究腫瘤異質(zhì)性，又使用全外顯子組測序(WES)和拷貝數(shù)變異(CNV)從ATAC-seq數(shù)據(jù)來研究NEC樣本的遺傳特征，為亞型相關(guān)研究提供了更多的研究思路。
