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經(jīng)過昨天對微生物的刻畫后，大家對微生物與腫瘤的關(guān)系應(yīng)該有了個(gè)全面的了解了。
在1911年發(fā)現(xiàn)勞斯肉瘤病毒的推動(dòng)下，癌癥的病毒理論蓬勃發(fā)展。勞斯肉瘤病毒使雞的良性組織轉(zhuǎn)變?yōu)閻盒阅[瘤。長達(dá)數(shù)十年的尋找每一種人類癌癥背后的病毒的努力最終都以失敗告終，許多癌癥都與體細(xì)胞突變有關(guān)。現(xiàn)在，該領(lǐng)域遇到了一些耐人尋味的說法，稱包括細(xì)菌和真菌在內(nèi)的微生物在癌癥和癌癥治療中的重要性。在臨床前模型中，微生物代謝物還調(diào)節(jié)腫瘤體細(xì)胞突變的表型，并調(diào)節(jié)免疫檢查點(diǎn)抑制劑的療效。總之，整合以宿主為中心和以微生物為中心的癌癥觀點(diǎn)可能會(huì)改善患者的預(yù)后，
那么今天就跟大家分享一篇利用新型癌癥微生物組特征預(yù)測人類乳腺癌患者預(yù)后的文章，整篇文章工作量不大，亮點(diǎn)在于與傳統(tǒng)的基因特征預(yù)測不同，而是利用了TCGA 中乳腺癌微生物組數(shù)據(jù)來建立signature，下面具體看一下研究內(nèi)容吧。
背景：
1、乳腺癌（BC）的復(fù)雜性和異質(zhì)性導(dǎo)致了對癌癥治療反應(yīng)的巨大差異。因此，迫切需要識(shí)別新的治療反應(yīng)和預(yù)后的生物標(biāo)志物，并發(fā)現(xiàn)新的潛在治療靶點(diǎn)，這也是個(gè)性化癌癥藥物的高需求。
2、目前對生物標(biāo)志物的鑒定主要集中在基因組和蛋白質(zhì)組基因的應(yīng)用上，許多相關(guān)的生物標(biāo)志物已被開發(fā)并用于臨床實(shí)踐。
3、盡管越來越多的證據(jù)表明微生物組在癌癥發(fā)展和治療中的重要性，但癌癥微生物組的臨床潛力尚未被探索。
4、研究揭示了微生物群與化療、放療和免疫治療反應(yīng)之間的關(guān)系：例如，銅綠假單胞菌分泌的因子增強(qiáng)了腫瘤細(xì)胞對阿霉素的敏感性；抗生素介導(dǎo)的細(xì)菌耗竭顯著降低了鉑化療和放療的療效。表明微生物組是預(yù)測癌癥患者預(yù)后的潛在生物標(biāo)志物。
研究結(jié)果：
一、微生物豐度預(yù)后模型建立與驗(yàn)證
1、單變量Cox回歸分析與乳腺癌患者OS（overall survival）顯著相關(guān)的微生物屬（圖1a）
2、根據(jù)上一步獲得的OS相關(guān)微生物屬將隊(duì)列分為微生物豐度高低組，Kaplan-Meier分析微生物豐度高低對OS的影響（圖1b-e）
3、多變量Cox回歸分析獨(dú)立影響OS的微生物屬，定義為微生物預(yù)后signature（MAPS）（圖2a）
4、利用MAPS將患者分為三個(gè)預(yù)后組（good，middle，poor），Kaplan-Meier分析及AUC曲線驗(yàn)證模型預(yù)測能力（圖2b-c）
二、MAPS的獨(dú)立臨床價(jià)值
1、雌激素受體（ER）狀態(tài)是影響乳腺癌患者預(yù)后的重要因素，分別對ER +和ER ?病人進(jìn)行了MAPS對OS和PFS的影響分析（圖3）
2、乳腺癌患者的分子亞型是另一個(gè)重要的預(yù)后因素，分析MAPS對各分子亞型患者OS和PFS的影響（圖4）
3、多變量Cox回歸分析驗(yàn)證MAPS是獨(dú)立預(yù)后因子（圖5）
4、綜合臨床因素評估MAPS的臨床價(jià)值（圖6）
小結(jié)：
這篇研究微生物預(yù)后signature的文章到這里就分享結(jié)束了。不知道了解完這篇文章的你是什么感受，小編內(nèi)心OS（此OS非彼OS+表情）：絕絕子，文章內(nèi)容這么少也能發(fā)3+？冷靜下來仔細(xì)思考，工作量大也不一定能發(fā)文章，而能發(fā)文章的核心是什么，在新不在多??！
目前越來越多的證據(jù)表明微生物與癌癥預(yù)后的關(guān)系，包括胰腺癌[1]、乳腺癌等。小編認(rèn)為微生物對癌癥生物學(xué)的貢獻(xiàn)可能會(huì)在未來十年的癌癥研究中占據(jù)中心位置，同時(shí)對癌癥診斷、患者分層、治療和預(yù)后產(chǎn)生更多貢獻(xiàn)。
如果您也有癌癥相關(guān)微生物數(shù)據(jù)不會(huì)做分析的，或者沒數(shù)據(jù)也想在微生物領(lǐng)域快速做科研的（各癌癥微生物數(shù)據(jù)生信人已經(jīng)整理好）想法，不要猶豫，畢竟數(shù)據(jù)里微生物種類也不多，猶豫一下少一個(gè)！
參考文獻(xiàn)：[1]Tumor Microbiome Diversity and Composition Influence Pancreatic Cancer Outcomes
