元素周期表的新啟示之銅死亡
1.前言
截止日前,國自然的申請工作即將步入尾聲,大家將能寫的都寫好了,關(guān)于中不中的下面就看天意了。我們知道其實(shí)有關(guān)細(xì)胞死亡相關(guān)的標(biāo)書在國科金中一直都占據(jù)著很高的比例,細(xì)胞死亡相關(guān)的研究一直都是國自然的熱點(diǎn)研究領(lǐng)域之一。這些細(xì)胞死亡的方式有多種形式,其中包括細(xì)胞凋亡(Apoptosis)、細(xì)胞自噬(Autophagy)、細(xì)胞焦亡(Pyroptosis),以及鐵死亡(Ferroptosis)等等。
在讀本篇推文之前,大多數(shù)小伙伴肯定或多或少的都聽說過鐵死亡,就是那個在前幾年換個腫瘤模型都能發(fā)SCI的數(shù)據(jù)挖掘熱點(diǎn)。其背后的生物學(xué)基礎(chǔ)是因?yàn)殍F可以催化有毒膜脂質(zhì)過氧化物的形成,這是鐵死亡的主要特征,這是一種獨(dú)特的非凋亡性細(xì)胞死亡形式。但是很少有人知道的是,其實(shí)金屬誘導(dǎo)的死亡有很多,除了鐵死亡還有鋅死亡(過量的鋅可以通過抑制三磷酸腺苷(ATP)合成來引發(fā)非凋亡性細(xì)胞死亡),鎂死亡。吶,最近又出現(xiàn)一個銅死亡。于是小編默默的拿出了元素周期表進(jìn)行了端詳了起來。。。
下一個是鈉死亡?鉀死亡?
近日,博德研究所的科學(xué)家揭示銅毒性涉及特定線粒體代謝酶的破壞,從而引發(fā)一種不尋常的細(xì)胞死亡機(jī)制。這種機(jī)制可以解釋與遺傳性銅過載疾病相關(guān)的病理學(xué),并提出利用銅毒性治療癌癥的新方法。這項(xiàng)研究成果發(fā)表在Science上,篇名為“Copper induces cell death by targeting lipoylated TCA cycle proteins”,那么下面Immugent來和大家一起學(xué)習(xí)一下這項(xiàng)最近火爆的熱點(diǎn)研究吧!
2.銅離子載體誘導(dǎo)新型細(xì)胞死亡,其啟動與細(xì)胞呼吸相關(guān)
這個科研團(tuán)隊(duì)其實(shí)一直都在做銅離子相關(guān)的研究工作,銅基毒性的探索的相關(guān)工作最早開始于2019年,研究人員通過系統(tǒng)地測試了銅載體的毒性,得出了其產(chǎn)生的毒性源于銅本身的假設(shè)。他們發(fā)現(xiàn),許多不同的銅結(jié)合分子,或銅離子載體,都可以以類似的方式誘導(dǎo)細(xì)胞死亡,而這一過程完全取決于銅的可用性。此外,研究人員還發(fā)現(xiàn),這種細(xì)胞死亡的形式(他們稱之為表皮壞死)與其他已被充分研究的形式不同。當(dāng)研究人員阻斷了已知的細(xì)胞死亡途徑,如細(xì)胞凋亡和鐵中毒時,用銅離子載體處理的細(xì)胞仍然死亡。
在這項(xiàng)研究中,研究人員首先在489個細(xì)胞系中檢測了1448個載銅藥物對細(xì)胞的殺傷效果,結(jié)果發(fā)現(xiàn)這些載銅藥物均能殺傷細(xì)胞。而改變這些藥物的銅結(jié)合能力會使其喪失對細(xì)胞的殺傷效果。研究發(fā)現(xiàn)單獨(dú)加入銅結(jié)合分子Elesclomol(伊利司莫)并不影響細(xì)胞的生長,而一旦加入銅離子,就會抑制細(xì)胞生長。隨后,作者通過相關(guān)實(shí)驗(yàn)觀察到更依賴線粒體呼吸的細(xì)胞對銅離子的敏感性比進(jìn)行糖酵解的細(xì)胞高近1000倍。采用藥物干預(yù)線粒體功能后,細(xì)胞對銅離子的敏感性發(fā)生顯著變化。
通過乏氧條件培養(yǎng)細(xì)胞,作者進(jìn)一步證實(shí)了銅誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡需要線粒體呼吸參與,而糖酵解產(chǎn)生的ATP對銅誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡影響較小。緊接著,作者還發(fā)現(xiàn)銅并不直接參與電子傳輸鏈(ETC),而只是在三羧酸(TCA)循環(huán)中發(fā)揮作用。隨后通過對細(xì)胞進(jìn)行代謝組學(xué)測序發(fā)現(xiàn),對銅敏感細(xì)胞中與TCA相關(guān)的代謝物明顯更多。這些結(jié)果表明銅誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡與線粒體代謝之間緊密聯(lián)系,銅與TCA循環(huán)之間息息相關(guān)。
3. 銅死亡的關(guān)鍵調(diào)控基因FDX1,是蛋白質(zhì)脂化的上游調(diào)節(jié)因子
為了確定介導(dǎo)銅毒性的特定代謝途徑,研究者通過多重CRISPR基因敲除篩選,確定了促進(jìn)銅誘導(dǎo)死亡的關(guān)鍵基因-FDX1(該基因編碼一種Elesclomol可直接靶向的蛋白,該蛋白可將二價銅離子轉(zhuǎn)化更毒的一價銅離子)。研究還發(fā)現(xiàn)敲除FDX1會減弱銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡。此外,當(dāng)細(xì)胞在糖酵解條件下生長時,大多數(shù)銅離子載體(如elesclomol、disulfiram和NSC319726)失去了殺傷活性。這一結(jié)果進(jìn)一步表明銅與線粒體代謝密切相關(guān)。
研究者進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),敲除FDX1或硫鋅?;嚓P(guān)酶可以使細(xì)胞免于銅毒性,因此推測FDX1可能是蛋白質(zhì)硫鋅?;纳嫌握{(diào)節(jié)因子。首先通過對公共數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘,作者發(fā)現(xiàn)FDX1和硫辛酸代謝與細(xì)胞存活高度相關(guān)。其次對208例人類腫瘤標(biāo)本進(jìn)行了FDX1和硫辛酸的免疫組化檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)FDX1和硫鋅?;鞍椎谋磉_(dá)高度相關(guān)。最后通過Western-blot和免疫組化在蛋白水平對該基因進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)FDX1基因敲除導(dǎo)致蛋白質(zhì)硫鋅?;耆珕适?,同時也導(dǎo)致細(xì)胞呼吸顯著下降。這些結(jié)果均表明FDX1是蛋白質(zhì)硫鋅?;纳嫌握{(diào)節(jié)因子。研究還發(fā)現(xiàn)銅干擾鐵硫簇,而鐵硫簇是幾種關(guān)鍵代謝酶的一部分。當(dāng)這種酶降低時,細(xì)胞更容易死亡。
4.系統(tǒng)揭示化學(xué)和基因誘導(dǎo)的銅依賴細(xì)胞死亡的共同機(jī)制
雖然這是銅死亡真正意義上發(fā)表的第一篇系統(tǒng)性研究論文,但事實(shí)上這種新的細(xì)胞死亡機(jī)制的一部分已被發(fā)生在細(xì)菌和酵母中,因此研究人員認(rèn)為該研究可以揭示各種生物過程,包括產(chǎn)生具有抗菌特性銅離子載體的微生物,以及患有銅失調(diào)遺傳病的人,例如威爾遜氏病患者。
最后,研究人員發(fā)現(xiàn)通過銅載體穿提到線粒體內(nèi)的銅離子直接與這些脂?;揎椀牡鞍踪|(zhì)結(jié)合,導(dǎo)致它們形成長鏈和團(tuán)塊化,從而導(dǎo)致細(xì)胞死亡,這些銅離子還會干擾鐵硫簇,從而導(dǎo)致鐵硫蛋白下調(diào),導(dǎo)致細(xì)胞毒性應(yīng)激并死亡。這些在銅毒性小鼠模型中的研究結(jié)果表明,銅超載導(dǎo)致的細(xì)胞效應(yīng)與銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞效應(yīng)相同。綜上所述,這個的數(shù)據(jù)支持了一個模型,即過量銅促進(jìn)脂化蛋白的聚集和Fe-S簇蛋白的不穩(wěn)定,從而導(dǎo)致蛋白毒性應(yīng)激并最終導(dǎo)致細(xì)胞死亡。
盡管Elesclomol在其作為癌癥治療劑的臨床試驗(yàn)中失敗了,但后來的分析表明,該銅離子載體已經(jīng)幫助了腫瘤依賴線粒體產(chǎn)生能量的患者。既然該團(tuán)隊(duì)已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了銅誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡的標(biāo)志物,他們認(rèn)為伊利司莫有可能用于治療一系列特別容易受到該過程影響的癌癥,例如那些高表達(dá)FDX1基因的癌癥細(xì)胞。
5.展望
好啦,文章讀完了,熱鬧也看完了,該說正事了!
像鐵死亡前幾年剛被提出來時一樣,銅死亡必定會成為下一個研究熱點(diǎn)。如不出意外,很多會數(shù)據(jù)挖掘的小伙伴就已經(jīng)行動起來了,因?yàn)檫@篇Science不僅給出了銅死亡的一個關(guān)鍵基因--FDX1,還給出了一系列銅死亡相關(guān)的基因,我們可以將這些基因制作成銅死亡相關(guān)Signature,換個癌癥擼一遍就是一篇不錯的SCI!
當(dāng)然,上面只是對那些只想水文章的小伙伴說的,對于想做大研究的小伙伴,這項(xiàng)研究依然可以提供很多研究思路。比如,可以實(shí)驗(yàn)一些你所在領(lǐng)域的細(xì)胞系,然后用不同的金屬離子處理,觀察處理前后細(xì)胞出現(xiàn)了哪些功能變化。當(dāng)然,還可以使用不同的金屬離子組合來進(jìn)行研究,或許就會發(fā)現(xiàn)下一個新型的細(xì)胞死亡誘導(dǎo)機(jī)制,趕快行動起來吧!