轉(zhuǎn)化生長因子-β (TGF-β) 是一種分泌型多功能細(xì)胞因子,TGF-β在癌癥中大量表達(dá),與不良臨床結(jié)局相關(guān)。TGF-β發(fā)揮全身免疫抑制作用并抑制宿主免疫監(jiān)視??蓮?qiáng)烈調(diào)節(jié)免疫細(xì)胞的活性(抑制免疫細(xì)胞:CD8+T細(xì)胞、NK細(xì)胞、M1型巨噬細(xì)胞、B細(xì)胞;促進(jìn)免疫抑制細(xì)胞:Treg細(xì)胞、M2型巨噬細(xì)胞)。同時促進(jìn)皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化 (EMT)、癌細(xì)胞侵襲和遷移、細(xì)胞外基質(zhì) (ECM) 沉積、血管生成和癌癥相關(guān)成纖維細(xì)胞形成(CAF)等惡性特征。
TGF-β個性化純生信思路挖掘
立即掃碼咨詢
(ref1:35461253/Mol Cancer/IF:27; ref2:20538542/Trends Immunol/IF:16; ref3:33823905/J Hematol Oncol/17; ref4:32710082/Nat Rev Clin Oncol/IF:66)
因?yàn)門GF-β能加劇對眾多免疫細(xì)胞功能的抑制,阻止了T細(xì)胞向腫瘤中心的滲透,使腫瘤細(xì)胞逃脫于免疫監(jiān)視及免疫系統(tǒng)的追擊,導(dǎo)致對免疫治療并不敏感。那么作為免疫治療的新靶點(diǎn),純生信文章怎么來闡述它與免疫治療的關(guān)聯(lián)呢,今天小編就整理了3篇TGF-β與腫瘤免疫以及免疫治療如何關(guān)聯(lián)的純生信文章供大家參考。
第一篇:高的TGF-βsignature 可預(yù)測婦科癌癥患者的免疫治療耐藥性(基于自測免疫治療的隊列逐步分析發(fā)現(xiàn)TGF-βsignature與免疫治療獲益相關(guān))
主要步驟及結(jié)果
分析接受ICI免疫治療婦科腫瘤隊列免疫反應(yīng)與免疫治療標(biāo)記物的關(guān)聯(lián)
整體的響應(yīng)免疫治療的marker識別及上游最顯著的調(diào)控因子識別(KRAS, ESR1,IGF1, CCN2, THRB, and TGFB1)
基于不同婦科癌種主要響應(yīng)marker篩選,發(fā)現(xiàn)6個TGF-β信號通路基因表達(dá)與免疫治療時的生存獲益相關(guān),并由相關(guān)基因構(gòu)建TGF-βscore,結(jié)果表明TGF-βscore低的患者接受免疫治療有顯著改善(整體隊列+卵巢癌隊列)
接下來對免疫浸潤細(xì)胞進(jìn)行了分析以及TGF-β在誘導(dǎo)免疫抑制腫瘤免疫微環(huán)境中的機(jī)制
第二篇:構(gòu)建新的TGF-βsignature預(yù)測膀胱癌臨床結(jié)局及腫瘤免疫微環(huán)境表型(基于公開的癌型隊列和免疫治療隊列研究TGF-βsignature與免疫表型和免疫治療關(guān)聯(lián);非常巧的是與上一篇同一天發(fā)表)
主要步驟及結(jié)果
篩選差異的TGF-β基因構(gòu)建和驗(yàn)證TGF-βsignature預(yù)測OS
結(jié)合臨床特征分析TGF-βsignature的獨(dú)立預(yù)后性能以及構(gòu)建和驗(yàn)證整合的列線圖(準(zhǔn)確性在 0.8左右)
3、TGF-β signature預(yù)測TME表型及免疫治療效果(訓(xùn)練集及測試集)
4、TGF-β signature預(yù)測臨床表型及潛在治療候選藥物(訓(xùn)練集及測試集)
第三篇:腎透明細(xì)胞癌TGF-β信號通路的突變和表達(dá)改變的多組學(xué)分析(新鮮出爐2022年4.11搶先發(fā)表)
主要步驟及結(jié)果
差異的TGF-β信號通路基因差比表達(dá)展示和預(yù)后能力展示;無監(jiān)督聚類識別腫瘤TGF-β相關(guān)亞型,構(gòu)建預(yù)后TGF-βsignature,評估預(yù)測效能
TGF-βsignature關(guān)聯(lián)腫瘤驅(qū)動等關(guān)鍵maker基因及基于藥物IC50值預(yù)測潛在靶向藥,分析通路基因與TME細(xì)胞相關(guān)型和免疫治療響應(yīng)狀況
構(gòu)建TGF-βsignature并在獨(dú)立數(shù)據(jù)集中進(jìn)行驗(yàn)證、獨(dú)立預(yù)后分析以及列線圖構(gòu)建
TGF-β信號通路的泛癌研究
小結(jié):
對于TGF-β信號通路純生信的分析到這就結(jié)束了,全網(wǎng)小編也只找到了3篇相關(guān)的純生信文章??梢钥吹讲徽撌亲詼y數(shù)據(jù)還是公共數(shù)據(jù)出發(fā)研究者們都發(fā)現(xiàn)了TGF-β信號通路與腫瘤免疫狀態(tài)顯著相關(guān),并且通過構(gòu)建TGF-βsignature也能對免疫治療或非免疫治療隊列的生存進(jìn)行預(yù)測。這個與我們最初的觀點(diǎn)是自洽的。小編還初步探索了其它癌型預(yù)后跟TGF-β信號通路的相關(guān)性(下圖),初步結(jié)果可見研究TGF-β信號通路的科研意義。
TGF-β個性化純生信思路挖掘
立即掃碼咨詢