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本月中山大學(xué)陳明遠(yuǎn)教授在nature communications（IF：17.694）發(fā)表了研究論文，該研究探索了與鼻咽癌(NPC)轉(zhuǎn)移相關(guān)的因素。對(duì)163個(gè)匹配的血液和原發(fā)性、區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移腫瘤樣本進(jìn)行了整合基因組分析，并結(jié)合了來(lái)自?xún)擅颊叩?1個(gè)樣本的單細(xì)胞RNA-seq。研究了轉(zhuǎn)移性腫瘤與原發(fā)性和區(qū)域性淋巴結(jié)腫瘤異同。進(jìn)而研究了轉(zhuǎn)移的不同途徑及其特點(diǎn)。
鼻咽癌(NPC)起源于鼻咽上皮，在東南亞最常見(jiàn)，中國(guó)廣東廣東人的發(fā)病率最高。臨床試驗(yàn)表明，化療加大劑量局部放療可以提高新生轉(zhuǎn)移性鼻咽癌患者的總生存率(OS)。此外，局部放療還減少了遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移性復(fù)發(fā)。然而，63例患者中有17例在局部放療結(jié)束后未達(dá)到客觀(guān)緩解(完全或部分緩解)。因此，揭示促進(jìn)這種協(xié)同作用的機(jī)制，并篩選適合高強(qiáng)度局部放療的患者是至關(guān)重要的。大規(guī)模的基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究揭示了鼻咽癌樣本的突變格局和不同的亞型。但目前沒(méi)有對(duì)轉(zhuǎn)移鼻咽癌的基因組結(jié)構(gòu)做出定義，進(jìn)而識(shí)別轉(zhuǎn)移的時(shí)間或空間模式。
首先，從44名鼻咽癌患者中獲得了167個(gè)腫瘤樣本(83個(gè)原發(fā)病灶、44個(gè)區(qū)域淋巴結(jié)病變和40個(gè)轉(zhuǎn)移病灶)和35個(gè)匹配的血液樣本(圖1a)。并對(duì)這些樣本進(jìn)行全外顯子組/全基因組測(cè)序(WES/WGS)、RNA-seq、scRNA-seq(圖1b)。轉(zhuǎn)移性腫瘤樣本具有與原發(fā)性和區(qū)域性淋巴結(jié)腫瘤相似的非沉默突變負(fù)荷(圖2a)。原發(fā)性、區(qū)域性淋巴結(jié)和轉(zhuǎn)移性腫瘤的主要替代類(lèi)型是C > T轉(zhuǎn)移，這也是不同鼻咽癌病理亞型報(bào)告的主要特征(圖2b)。使用非負(fù)矩陣分解，在所有樣本中識(shí)別出5個(gè)穩(wěn)健突變signature，并根據(jù)COSMIC數(shù)據(jù)庫(kù)將5個(gè)突變標(biāo)記被注釋為2、4、5、6和13 signature(圖2c-e)?？偟膩?lái)說(shuō)，不同的樣本有不同的顯性突變特征，但AID/APOBEC相關(guān)的特征，包括Signature 13和Signature 2，是所有樣本中貢獻(xiàn)最大的兩個(gè)特征，轉(zhuǎn)移性腫瘤樣本的突變譜的總體模式與原發(fā)性和區(qū)域性淋巴結(jié)腫瘤樣本的突變譜相似(圖2f)。Signature 6在轉(zhuǎn)移性腫瘤中的主導(dǎo)地位進(jìn)一步表明，缺陷DNA錯(cuò)配修復(fù)可能對(duì)NPC的進(jìn)展產(chǎn)生廣泛而重要的影響(圖2d，e)。
為了評(píng)估鼻咽癌中的瘤內(nèi)異質(zhì)性（ITH），作者重建了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(圖3a，b)。平均而言，在原發(fā)和區(qū)域淋巴結(jié)腫瘤中，分別只有20.79%和22.29%的突變表現(xiàn)為所有區(qū)域共有的主干突變。這說(shuō)明原發(fā)性和區(qū)域性淋巴結(jié)腫瘤中存在大量高ITH。此外，通過(guò)根據(jù)癌細(xì)胞分?jǐn)?shù)(CCF)將體細(xì)胞變異分為克隆和亞克隆突變，轉(zhuǎn)移性腫瘤中亞克隆突變的比例與原發(fā)和區(qū)域淋巴結(jié)中的相當(dāng)(圖3c)。亞克隆突變?cè)谠l(fā)腫瘤中的比例與區(qū)域淋巴結(jié)/遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移腫瘤中的比例呈正相關(guān)(圖3d)。作者還采用MATH評(píng)分來(lái)評(píng)估腫瘤的ITH，結(jié)果顯示，原發(fā)性、區(qū)域淋巴結(jié)和轉(zhuǎn)移性腫瘤的ITH相似（圖3e，f)。這些結(jié)果表明鼻咽癌具有較高的ITH，區(qū)域淋巴結(jié)和轉(zhuǎn)移性腫瘤可能繼承了這一特征。
然后，使用MutSigCV分別鑒定原發(fā)、區(qū)域淋巴結(jié)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移腫瘤中的顯著突變基因(SMGs)。除了在之前報(bào)道中提到的頻繁突變的基因，還發(fā)現(xiàn)了其他SMGs，如SIX2和RPLP1(圖1c)。生成了31個(gè)“driver genes”的組合列表(圖1c)。雖然大多數(shù)驅(qū)動(dòng)基因在三個(gè)位點(diǎn)的突變頻率高度相似，但SIX2和NOTCH2在轉(zhuǎn)移性腫瘤樣本中的突變頻率明顯高于原發(fā)腫瘤樣本(圖1c)，提示SIX2和NOTCH2可能在鼻咽癌轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要作用。（SIX2是一種發(fā)育轉(zhuǎn)錄因子，通過(guò)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)途徑或誘導(dǎo)癌癥干細(xì)胞程序促進(jìn)乳腺癌轉(zhuǎn)移。NOTCH2是一種新發(fā)現(xiàn)的癌基因，通常在一系列癌癥中過(guò)度表達(dá)，可促進(jìn)膀胱癌的腫瘤生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。）
通過(guò)GISTIC算法使用WES數(shù)據(jù)獲得體細(xì)胞拷貝數(shù)改變(SCNAs)。并根據(jù)GISTIC2獲得了“擴(kuò)增(AMP)”和“缺失(DEL)”改變(圖1d)。與原發(fā)腫瘤相比，區(qū)域淋巴結(jié)或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移腫瘤中未檢測(cè)到明顯差異的SCNAs。先前報(bào)道的眾所周知的9p21.3 (CDKN2A)、3p21.31 (RASSF1)等拷貝數(shù)缺失和11q13.3 (CCND1)、3q26.1 (PIK3CA)等擴(kuò)增在所有三個(gè)位點(diǎn)均普遍存在。盡管在鼻咽癌中發(fā)現(xiàn)了高ITH，但原發(fā)性、區(qū)域性淋巴結(jié)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移性腫瘤的基本基因組特征是相似的。
為了研究鼻咽癌轉(zhuǎn)移過(guò)程中選擇的驅(qū)動(dòng)事件，作者系統(tǒng)地描述了每種變體的克隆性以及基于變體CCFs的轉(zhuǎn)移性鼻咽癌的腫瘤亞克隆結(jié)構(gòu)。在轉(zhuǎn)移過(guò)程中，根據(jù)原發(fā)腫瘤和轉(zhuǎn)移腫瘤之間的克隆性動(dòng)態(tài)變化，11,148個(gè)變體被分為四組(圖4a)：
NFKBIA、TET2、BAP1、TP53和FAT1等驅(qū)動(dòng)基因存在體細(xì)胞突變的克隆在轉(zhuǎn)移中明顯“selected”(圖4a)。此外，所選組的體細(xì)胞突變?cè)贓MT、有絲分裂紡錘體、根尖連接、炎癥反應(yīng)和E2F靶標(biāo)等癌癥轉(zhuǎn)移相關(guān)通路中顯著富集(圖4b)。
據(jù)報(bào)道，大約20%-30%的鼻咽癌患者在標(biāo)準(zhǔn)放化療后會(huì)發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。
在治療后轉(zhuǎn)移性腫瘤中持續(xù)存在的克隆變異可能不僅與治療耐藥性有關(guān)，還可能與腫瘤轉(zhuǎn)移有關(guān)。首先，如KRAS擴(kuò)增、JAK2擴(kuò)增、CADM1缺失和NFKBIA缺失，在殘余原發(fā)腫瘤中是克隆的，但在預(yù)處理原發(fā)腫瘤中是亞克隆的或無(wú)法檢測(cè)到的，這表明這些事件可能與治療耐藥性和進(jìn)一步的轉(zhuǎn)移進(jìn)展有關(guān)(圖4d)。（KRAS已知在各種癌癥類(lèi)型中賦予化療耐藥；NFKBIA是NF-κB通路的知名負(fù)調(diào)控因子，據(jù)報(bào)道可增強(qiáng)鼻咽癌的化療耐藥性。）其次，TP53、ARID1A和TRAF3等基因中的SNVs和ATG13缺失、KMT2D擴(kuò)增和ARID1A缺失等CNVs在治療后進(jìn)展性轉(zhuǎn)移腫瘤中明顯“selected”(圖2e)。除EP300擴(kuò)增、FBXW7缺失和PTEN缺失外，大多數(shù)在治療后轉(zhuǎn)移瘤中“selected”CNVs也被發(fā)現(xiàn)在預(yù)處理轉(zhuǎn)移樣本中“selected”(圖4c，e)。（EP300是食管癌鱗狀上皮癌中最重要的基因，通過(guò)下調(diào)FBXW749來(lái)改變腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的極化，從而促進(jìn)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤的腫瘤進(jìn)展。FBXW749是一種關(guān)鍵的腫瘤抑制因子，在超過(guò)30%的人類(lèi)癌癥中被刪除。）EP300擴(kuò)增和FBXW7缺失可能對(duì)鼻咽癌轉(zhuǎn)移的進(jìn)展有協(xié)同作用。此外，在殘留原發(fā)腫瘤中發(fā)現(xiàn)的所有“selected”變異在治療前和治療后的轉(zhuǎn)移樣本中也“selected”，這證明這些變異不是由治療引起的，可能在引發(fā)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移中起著至關(guān)重要的作用。
作者進(jìn)一步檢查了治療后主要?dú)埩魳颖净颊?P27, P31和P32)的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。發(fā)現(xiàn)治療前的進(jìn)展性轉(zhuǎn)移樣本和原發(fā)樣本聚類(lèi)在同一分支中，表明治療后的進(jìn)展性轉(zhuǎn)移病灶與治療前的原發(fā)病灶相關(guān)，可能源于治療前的原發(fā)病灶克隆。相比之下，進(jìn)展性轉(zhuǎn)移樣本和治療后原發(fā)性殘留樣本在P32中聚類(lèi)為同一支，表明進(jìn)展性轉(zhuǎn)移可能源于治療后原發(fā)性殘留病灶的克隆(圖4f)。根據(jù)P32的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，在進(jìn)展性轉(zhuǎn)移樣本和治療后殘留的原發(fā)腫瘤樣本中都存在克隆性NFKBIA缺失，但在預(yù)處理原發(fā)腫瘤中不存在；克隆性ARID1A缺失僅在進(jìn)展性轉(zhuǎn)移中被檢測(cè)到(圖4g)。這表明NKFBIA缺失和ARID1A缺失可能導(dǎo)致了P32的治療耐藥性，并進(jìn)一步引發(fā)了遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。
根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)，作者識(shí)別了兩種轉(zhuǎn)移的進(jìn)化途徑：
采用bootstrapping策略來(lái)評(píng)估每個(gè)轉(zhuǎn)移的轉(zhuǎn)移途徑的概率。從兩名患者(P05和P06)中篩選出了不符合概率臨界值(0.75)的兩個(gè)轉(zhuǎn)移瘤，從8名患者中篩選出了11個(gè)經(jīng)淋巴途徑播撒的轉(zhuǎn)移性瘤；5名患者中有8個(gè)通過(guò)血行途徑傳播的轉(zhuǎn)移性瘤(圖5b)。
基于突變CCF的亞克隆進(jìn)化分析進(jìn)一步證實(shí)了該發(fā)現(xiàn)。淋巴途徑的轉(zhuǎn)移性腫瘤與區(qū)域性淋巴結(jié)腫瘤共享至少一個(gè)私有亞克隆，而血液途徑的轉(zhuǎn)移性腫瘤與區(qū)域性淋巴結(jié)腫瘤不共享任何亞克隆(圖5c)。相比之下，P04的轉(zhuǎn)移瘤(甲狀腺)血源性進(jìn)化模型起源于原發(fā)腫瘤。P04的遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移性和區(qū)域淋巴結(jié)腫瘤沒(méi)有聚集到系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的同一分支中，也沒(méi)有共享任何私有亞克隆(圖5d)?？傮w而言，除P14-Met3和P01-Met外，89.47%的遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移病灶的進(jìn)化路線(xiàn)通過(guò)亞克隆進(jìn)化分析得到驗(yàn)證。
來(lái)自同一病人的不同轉(zhuǎn)移性腫瘤傾向于遵循相同的進(jìn)化路線(xiàn)。P07的肝和肺轉(zhuǎn)移是從區(qū)域淋巴結(jié)演化而來(lái)的，P14的所有轉(zhuǎn)移腫瘤(肝、骨和腹股溝淋巴結(jié))也都是從區(qū)域淋巴結(jié)腫瘤演化而來(lái)的(圖5e，f)。同樣，P15的所有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移性腫瘤(多個(gè)腋窩淋巴結(jié))都來(lái)自原發(fā)腫瘤(圖5g)。
進(jìn)一步對(duì)來(lái)自淋巴(P14)和血行(P15)轉(zhuǎn)移患者的匹配的原發(fā)性、區(qū)域性淋巴結(jié)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移性腫瘤進(jìn)行了scRNA-seq，得到了53913個(gè)細(xì)胞(圖6a-c)。繪制樣本來(lái)源的細(xì)胞，通過(guò)Monocle2觀(guān)察到連續(xù)的腫瘤進(jìn)化軌跡(圖6d-e)。有趣的是，原發(fā)腫瘤細(xì)胞首先遷移到區(qū)域淋巴結(jié)，然后按照不同的路線(xiàn)擴(kuò)散到骨和腹股溝淋巴結(jié)或肝臟，這與利用基因組數(shù)據(jù)構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)揭示的淋巴進(jìn)化路線(xiàn)密切一致(圖6d)。相比之下，來(lái)自原發(fā)和轉(zhuǎn)移部位的惡性細(xì)胞混合，在P15中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)與樣本來(lái)源相關(guān)的明確進(jìn)化路線(xiàn)，這可能是由于腫瘤細(xì)胞從原發(fā)腫瘤直接擴(kuò)散到區(qū)域淋巴結(jié)或由系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)揭示的遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(圖6e)。
接下來(lái)，作者研究了這兩種途徑是否具有不同的基因組特征。突變signature 6(DNA錯(cuò)配修復(fù)相關(guān))在血行途徑中顯著富集(圖7a)。通過(guò)淋巴途徑轉(zhuǎn)移瘤比血行途徑的轉(zhuǎn)移瘤具有明顯更多的“selected”突變(圖7b)。
bulk RNA-seq和scRNA-seq數(shù)據(jù)顯示，淋巴途徑的原發(fā)腫瘤在EMT、UV反應(yīng)和血管生成等途徑中顯著富集，而血行途徑的原發(fā)腫瘤在IFN-α和IFN-γ反應(yīng)途徑中顯著富集(圖7c，d)。假設(shè)血行途徑原發(fā)腫瘤的免疫微環(huán)境中應(yīng)該存在更多的耗竭T細(xì)胞，這有利于腫瘤細(xì)胞的擴(kuò)散。重新聚集P14和P15原發(fā)腫瘤的免疫細(xì)胞。發(fā)現(xiàn)P14(淋巴途徑)和P15(血行途徑)的腫瘤免疫微環(huán)境有顯著差異。CD8+ T細(xì)胞在P14(淋巴途徑)中顯著升高。CD8+ T細(xì)胞進(jìn)一步聚成8個(gè)亞簇，并提取每個(gè)亞簇的標(biāo)記(圖7e，f)。細(xì)胞毒性降低的C7_CXCL13高表達(dá)耗盡標(biāo)記物在P15(血行途徑)中顯著豐富（圖7g）。進(jìn)一步通過(guò)標(biāo)記物CXCL13、TIM3和CD8的多重免疫組化(IHC)染色驗(yàn)證了該結(jié)果(圖7h)。由于免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICIs)可以重新激活耗盡的T細(xì)胞，因此有理由假設(shè)C7_CXCL13的富集可能表明對(duì)免疫治療有良好的反應(yīng)。為了確定高表達(dá)CXCL13的耗竭CD8+ T細(xì)胞的富集是否與免疫檢查點(diǎn)封鎖(ICB)更好的療效相關(guān)，作者收集了兩個(gè)公開(kāi)scRNA-seq數(shù)據(jù)集，發(fā)現(xiàn)在膀胱細(xì)胞癌(BCC)和透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌(ccRCC)中，衰竭的CD8+ T細(xì)胞在對(duì)ICB敏感的患者中比在對(duì)ICB耐藥的患者中更普遍。這些線(xiàn)索表明，通過(guò)血行途徑轉(zhuǎn)移的鼻咽癌患者可能對(duì)免疫治療產(chǎn)生良好的反應(yīng)。
經(jīng)血行途徑轉(zhuǎn)移的患者原發(fā)病灶較大，但區(qū)域淋巴結(jié)較低區(qū)域受累較少，骨轉(zhuǎn)移病灶較少(圖8a-c)，如圖P01淋巴途徑(圖8d)和P03血行途徑(圖8e)所示。作者提取原發(fā)腫瘤的圖像特征，然后建立一個(gè)基于機(jī)器學(xué)習(xí)的預(yù)測(cè)模型，以13例具有基因組證據(jù)的患者的放射組學(xué)數(shù)據(jù)為訓(xùn)練數(shù)據(jù)集，從血行途徑中識(shí)別淋巴路徑;該模型獲得了1.0的高準(zhǔn)確率和1.0的AUC(圖8f)。此外，將放射組學(xué)預(yù)測(cè)模型應(yīng)用于治療前沒(méi)有完全配對(duì)的原發(fā)性、區(qū)域性淋巴結(jié)和轉(zhuǎn)移性腫瘤樣本的患者。對(duì)于P25和P27，放射組學(xué)預(yù)測(cè)模型的結(jié)果與基因組證據(jù)相一致(圖8g)。此外，通過(guò)放射組學(xué)模型預(yù)測(cè)的血行途徑的原發(fā)腫瘤比淋巴途徑具有更高的IFN-α和IFN-γ反應(yīng)途徑活性(圖8h)，這與先前基于具有基因組證據(jù)的樣本的結(jié)果一致。
為了驗(yàn)證放射組學(xué)預(yù)測(cè)模型的準(zhǔn)確性，作者收集了額外匹配的原發(fā)性、區(qū)域性淋巴結(jié)和轉(zhuǎn)移性腫瘤(P49-P53)，然后利用放射組學(xué)預(yù)測(cè)模型構(gòu)建基因組系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)并同步預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)移路徑，結(jié)果表明基于基因組數(shù)據(jù)的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)與放射組學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)果一致(圖8i)。然后，將放射組學(xué)預(yù)測(cè)模型應(yīng)用于更大的臨床隊(duì)列，包括從頭轉(zhuǎn)移性鼻咽癌隊(duì)列和免疫治療隊(duì)列。臨床隊(duì)列中淋巴和血行途徑的影像學(xué)特征與訓(xùn)練數(shù)據(jù)集一致。由于臨床診斷的患者大多處于M0期，最終可能發(fā)生轉(zhuǎn)移，因此盡早預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)移路徑并實(shí)施特定的治療方式將會(huì)有很大幫助。因此，將預(yù)測(cè)模型應(yīng)用于M0期鼻咽癌隊(duì)列，發(fā)現(xiàn)血行組原發(fā)腫瘤的大小更大，下頸部淋巴結(jié)的數(shù)量比淋巴組更少。這些結(jié)果表明，放射組學(xué)預(yù)測(cè)模型可以對(duì)淋巴和血行途徑進(jìn)行分類(lèi)。
在13例有基因組證據(jù)的鼻咽癌轉(zhuǎn)移患者中，5例血行轉(zhuǎn)移患者的無(wú)進(jìn)展生存期(PFS)長(zhǎng)于8例淋巴轉(zhuǎn)移患者(圖9a)。在招募的104例新生轉(zhuǎn)移性鼻咽癌隊(duì)列中，26例通過(guò)血行轉(zhuǎn)移途徑轉(zhuǎn)移的患者的2年P(guān)FS時(shí)間明顯長(zhǎng)于78例通過(guò)淋巴途徑轉(zhuǎn)移的患者(圖9b)。
在104例轉(zhuǎn)移性鼻咽癌患者隊(duì)列中，治療結(jié)束評(píng)估轉(zhuǎn)移病灶時(shí)，局部區(qū)域放療與淋巴轉(zhuǎn)移途徑患者的客觀(guān)緩解率(ORR)顯著高于不進(jìn)行局部區(qū)域放療。相比之下，對(duì)于經(jīng)血行途徑轉(zhuǎn)移的患者，局部區(qū)域治療與不進(jìn)行局部區(qū)域放射治療相比，ORR沒(méi)有顯著提高(圖9c)。此外，淋巴轉(zhuǎn)移途徑的患者治療中加入局部區(qū)域放療可改善疾病控制，而血行轉(zhuǎn)移途徑的患者沒(méi)有明顯受益于聯(lián)合局部區(qū)域放療(圖9e，f)。
此外，在66例接受托利帕單抗、阿帕替尼和吉西他濱聯(lián)合免疫治療的免疫治療隊(duì)列中，14例血行組患者的ORR顯著高于52例淋巴組患者(圖9d)。這些發(fā)現(xiàn)表明，淋巴和血行轉(zhuǎn)移途徑可能有效地對(duì)疾病進(jìn)展高風(fēng)險(xiǎn)的患者進(jìn)行分層，并可能用于選擇特定患者進(jìn)行局部區(qū)域放療或免疫治療。
在這項(xiàng)工作中，作者收集了配對(duì)的鼻咽癌原發(fā)和轉(zhuǎn)移性腫瘤樣本，并進(jìn)行了基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，包括scRNA-seq，來(lái)追蹤鼻咽癌遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的進(jìn)化歷史。通過(guò)對(duì)成對(duì)的原發(fā)和轉(zhuǎn)移性鼻咽癌的大規(guī)模bulk和單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的綜合分析，可以更好地了解鼻咽癌轉(zhuǎn)移的進(jìn)化史以及局部區(qū)域治療對(duì)轉(zhuǎn)移性鼻咽癌影響的機(jī)制。該研究為鼻咽癌轉(zhuǎn)移的進(jìn)化軌跡和特征提供了廣泛的見(jiàn)解。描繪了鼻咽癌原發(fā)、區(qū)域淋巴結(jié)和轉(zhuǎn)移性腫瘤的全面基因組圖景。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析和scRNA-seq分析，觀(guān)察到兩種不同的遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的傳播途徑，包括區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的淋巴傳播和原發(fā)腫瘤的血行傳播。通過(guò)淋巴途徑的原發(fā)腫瘤在EMT、UV反應(yīng)和血管生成等途徑上顯著富集，而通過(guò)血行途徑的原發(fā)腫瘤在IFN-α和IFN-γ反應(yīng)途徑上顯著富集。并成功地利用放射組學(xué)數(shù)據(jù)將鼻咽癌轉(zhuǎn)移途徑分為淋巴轉(zhuǎn)移和血行轉(zhuǎn)移。最后，在淋巴轉(zhuǎn)移途徑患者的治療中加入局部區(qū)域放療可改善生存結(jié)局，而血行途徑患者則更多地受益于免疫治療。
