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小編在過(guò)去的很長(zhǎng)一段時(shí)間為大家介紹了許多細(xì)胞死亡領(lǐng)域的熱點(diǎn)，包括鐵死亡、細(xì)胞焦亡、壞死性凋亡等等，甚至包括前幾周刷爆全網(wǎng)的銅死亡?？赡苡行』锇楸容^疑惑，小編到底從哪搞到這些東西的。今天小編也不藏著掖著了，直接把壓箱底的寶貝分享給大家，也就是細(xì)胞死亡命名委員會(huì)（NCCD）在2018年的建議。NCCD在2018年明確定義了十二種調(diào)節(jié)性細(xì)胞死亡。
從圖中，我們可以看到一些熟悉的身影，比如前兩年火爆的鐵死亡和細(xì)胞焦亡。不過(guò)小編今天要為大家推薦的熱點(diǎn)是免疫原性細(xì)胞死亡（immunogenic cell death, ICD）。
目前免疫原性細(xì)胞死亡已經(jīng)成為標(biāo)準(zhǔn)腫瘤學(xué)詞匯的一部分，促進(jìn)了新治療劑、治療組合和個(gè)性化策略的開(kāi)發(fā)。其實(shí)早在2013年，科學(xué)家們就從癌癥治療的角度，討論了ICD的特征、潛在的細(xì)胞生物學(xué)、免疫效應(yīng)細(xì)胞感知ICD的通路，以及ICD對(duì)人類(lèi)病理生理學(xué)的潛在影響。期望未來(lái)ICD的概念能夠幫助開(kāi)發(fā)高效的治療方案。
時(shí)隔多年，終于有兩種基于ICD定義的抗癌藥物問(wèn)世了。其中一個(gè)是2020年FDA批準(zhǔn)的belantamab mafodotin，用于治療復(fù)發(fā)或者難治性多發(fā)性骨髓瘤的成人患者；另一個(gè)是FDA批準(zhǔn)的lurbinectedin，用于治療小細(xì)胞肺癌。
除此之外，ICD能成為熱點(diǎn)，還因?yàn)榻衲晁脑路軳ATURE IMMUNOLOGY再次強(qiáng)調(diào)了ICD在免疫監(jiān)視中的關(guān)鍵作用。而且，數(shù)百個(gè)正在進(jìn)行測(cè)試的臨床實(shí)驗(yàn)表明在ICD誘導(dǎo)化療后，腫瘤會(huì)從“冷”變“熱”，從而對(duì)免疫檢查點(diǎn)抑制劑有反應(yīng)。
當(dāng)然了，如果ICD已經(jīng)發(fā)表了大量文章，我們?cè)傧肴胧忠踩菀鬃曹?chē)。所以小編檢索了大量的文獻(xiàn)，發(fā)現(xiàn)目前只有兩篇純生信的文章。一篇是來(lái)自2015年的大規(guī)模meta分析，探索了免疫原性細(xì)胞死亡基因的預(yù)后潛能；一篇是來(lái)自去年的頭頸鱗狀細(xì)胞癌基于免疫原性細(xì)胞死亡的分子分型的文章。從結(jié)果來(lái)看，ICD方向留給了我們巨大的空間。
如果我們想研究ICD，還有哪些方向可以做呢？小編從生信的角度簡(jiǎn)單為大家總結(jié)幾個(gè)思路來(lái)練練手。
思路一、ICD相關(guān)signature
完全可以和鐵死亡或者細(xì)胞焦亡一致，基礎(chǔ)的思路就是基于這個(gè)基因集合進(jìn)行篩選，并且構(gòu)建一個(gè)signature。不到兩個(gè)月就能輕松做出一個(gè)3-5水平的結(jié)果。
思路二、ICD相關(guān)疾病分型
同樣的，我們完全可以參考鐵死亡的研究框架，而且前面我們提到，ICD目前已發(fā)表的文章中就有這么一篇。在為大家介紹銅死亡的時(shí)候，小編還提到，關(guān)于鐵死亡和細(xì)胞焦亡的分子分型的思路，同一個(gè)雜志接收了這類(lèi)文章。所以換個(gè)死亡方式是完全可行的。
思路三、單細(xì)胞數(shù)據(jù)出發(fā)或者單細(xì)胞聯(lián)合bulk RNA數(shù)據(jù)
關(guān)于這一點(diǎn)，小編在介紹銅死亡的時(shí)候，其實(shí)也分享過(guò)類(lèi)似的框架。單純的單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘或者聯(lián)合bulk RNA數(shù)據(jù)，能夠輕松做到6-7的水平。只不過(guò)與前兩個(gè)比起來(lái)，分析難度提升了不少。
免疫原性細(xì)胞死亡是什么？其實(shí)免疫原性細(xì)胞死亡是調(diào)節(jié)性細(xì)胞死亡的一種，一種足以在具有免疫能力的宿主中激活適應(yīng)性免疫的細(xì)胞死亡方式。在2005年，免疫原性細(xì)胞死亡概念被引入，用以區(qū)分驅(qū)動(dòng)抗原特異性免疫反應(yīng)并最終導(dǎo)致免疫記憶的RCD與僅參與固有免疫機(jī)制（通常是壞死）和引起主動(dòng)免疫抑制的RCD（通常是凋亡）。垂死的哺乳動(dòng)物細(xì)胞會(huì)發(fā)出許多與宿主相互作用的信號(hào)，以決定細(xì)胞應(yīng)激和死亡的免疫學(xué)相關(guān)性。在沒(méi)有反應(yīng)性抗原決定簇的情況下，這些信號(hào)可能會(huì)驅(qū)動(dòng)炎癥，但不能參與適應(yīng)性免疫。相反，當(dāng)細(xì)胞表現(xiàn)出足夠的抗原性時(shí)，例如在感染或者惡性細(xì)胞的情況下，它們的死亡可能會(huì)導(dǎo)致由細(xì)胞毒性T細(xì)胞執(zhí)行并引發(fā)免疫記憶的適應(yīng)性免疫反應(yīng)。
ICD可由一組有限的刺激引起，包括病毒感染、一些FDA批準(zhǔn)的藥物（蒽環(huán)類(lèi)藥物等）、特定形式的放療和光動(dòng)力治療。這些情況會(huì)時(shí)危險(xiǎn)相關(guān)分子模式（DAMP）的及時(shí)釋放，免疫系統(tǒng)固有和適應(yīng)性免疫組分表達(dá)的PRR會(huì)識(shí)別DAMP，警告機(jī)體有危險(xiǎn)的情況，導(dǎo)致引發(fā)通常與免疫記憶建立有關(guān)的免疫反應(yīng)。
目前，已經(jīng)有6種DAMP與RCD作為免疫原性的感知機(jī)制有關(guān)：
Calreticulin (CALR) 鈣網(wǎng)蛋白，ATP, High-mobility group 1, Type 1 IFN, Cancer cell-derived nucleic acid, Annexin A1。不過(guò)其中HMGB1和ANXA1在ICD的背景下的分子機(jī)制還有待闡明。
細(xì)胞死亡領(lǐng)域不僅僅只有我們所熟知的鐵死亡、細(xì)胞焦亡。其實(shí)細(xì)胞焦亡剛出來(lái)的時(shí)候，也不是什么熱點(diǎn)。小編為大家分享細(xì)胞焦亡的時(shí)候，綜合了多個(gè)層面的證據(jù)，表明了細(xì)胞焦亡隨后肯定是熱點(diǎn)，事實(shí)也證明小編沒(méi)有說(shuō)謊。今天為大家介紹的免疫原性細(xì)胞死亡，相信大家也看到了它的重要性和研究潛力，可別等文章都爛大街了，才反應(yīng)過(guò)來(lái)這是個(gè)熱點(diǎn)。
免疫原性細(xì)胞死亡相關(guān)思路
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