先聲明，預(yù)印本本身就是沒(méi)有經(jīng)過(guò)同行評(píng)議的，強(qiáng)調(diào)分享和開(kāi)放。這個(gè)沒(méi)有錯(cuò)誤，其所謂的觀點(diǎn)也屬于權(quán)威性不高，需要深入分析進(jìn)行分辨（本文也是）。
壹
18號(hào)biorxiv 上posted一篇關(guān)于新冠病毒跟中國(guó)南方Malayan pangolins (Manis javanica)的研究分析，由于作者是管軼引起了一陣轟動(dòng)，知識(shí)分子包括在內(nèi)的各平臺(tái)紛紛轉(zhuǎn)發(fā)。
文章小編也看了，大概的意思是目前發(fā)現(xiàn)穿山甲攜帶的冠狀病毒跟新冠的相似性比較高，有可能是潛在宿主，小心從事，建議把他們從菜市場(chǎng)解救出來(lái)。
小編想這篇文章更多的是呼吁，解救穿山甲，其實(shí)并不支持穿山甲是中間宿主。這一結(jié)論，這個(gè)潛在自然宿主貌似也不是很有根據(jù)。石正麗課題組發(fā)表的文章，大概率上支持新冠的自然宿主應(yīng)該是中華菊頭蝠的RaTG13,ncov病毒跟bat-cov RaTG13相似性最高96.2%。管的文章中系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)如下，穿山甲攜帶的病毒相似性在RaTG13之外。管的文章聲稱(chēng)其相似性在85.5% to 92.4%之間，低于RaTG13。所以暫時(shí)不能認(rèn)為其是中間宿主（中間宿主的話(huà)，整體相似性要高于RaTG13），也不能認(rèn)為其是自然宿主，相似性不是很高。但是其還是在摘要部分寫(xiě)了可能是中間宿主（傾向于）。The discovery of multiple lineages of pangolin coronavirus and their similarity to 2019-nCoV suggests that pangolins should be considered as possible intermediate hosts for this novel human virus and should be removed from wet markets to prevent zoonotic transmission.20號(hào)，在管的文章posted的第二天。biorxiv上炸開(kāi)了鍋，一共有三篇文章來(lái)討論這個(gè)事情。有的比較保守，題目研究的是新冠跟穿山甲攜帶病毒相似性的問(wèn)題，有的比較剛，直接題目就是論點(diǎn)。我們分別看下這文章，文章從系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)上，都不能支持穿山甲是中間宿主。分子和系統(tǒng)發(fā)育分析表明，穿山甲冠狀病毒（pangolin CoV）與2019年nCoV和蝙蝠冠狀病毒都有遺傳關(guān)系，但不支持2019年nCoV直接來(lái)自穿山甲CoV。我們的研究還表明穿山甲是betacornavirus的天然宿主，有可能感染人類(lèi)。
唯一的力證還是華南農(nóng)業(yè)大學(xué)的2月7號(hào)發(fā)布會(huì)的證據(jù)，99%的序列相似性。目前公布的信息雖然也是穿山甲，有可能是穿山甲品種不一樣，也有可能是攜帶的病毒不一樣。還是靜靜的等官方消息吧
緊接著也是20號(hào)，官方消息來(lái)了，他們公布了《Isolation and Characterization of 2019-nCoV-like Coronavirus from Malayan Pangolins》（《馬來(lái)亞穿山甲中2019-nCoV樣冠狀病毒的分離與鑒定》)在biorxiv上。在這項(xiàng)研究中，從馬來(lái)亞穿山甲中分離出的一種冠狀病毒亞型（Pangolin-CoV）在E，M，N和S基因中分別與2019-nCoV新冠病毒表現(xiàn)出100％，98.2％，96.7％和90.4％的氨基酸同一性。但是看下圖系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，臥槽，不是說(shuō)99%的序列相似性嗎（這里我猜有媒體進(jìn)行錯(cuò)誤解讀）。怎么還不如蝙蝠。臥槽，這新聞?wù)牡?，激?dòng)死個(gè)人，如今仔細(xì)看來(lái)，貌似啥也沒(méi)有。
只是說(shuō)多樣本混拼重組后相似性有這么高，單個(gè)毒株的不如蝙蝠。也就是說(shuō)暫時(shí)沒(méi)有任何證據(jù)直接支持穿山甲是中間宿主（to human），說(shuō)是潛在中間宿主，力度也不是很夠。21號(hào)，知識(shí)分子再發(fā)推時(shí)，對(duì)前天的文章進(jìn)行了刪稿處理。但是同時(shí)還有其他的兄弟平臺(tái)，還是被官方誤導(dǎo)了。所有的觀點(diǎn)又回到了13號(hào)biorxiv推文Evidence of recombination in coronaviruses implicating pangolin origins of nCoV2019 ，新冠的起源還是蠻復(fù)雜的。We identified high sequence
similarity in the RBM between nCoV-2019 and a coronavirus genome reconstructed from a viral
metagenomic dataset from pangolins possibly indicating a more complex origin for nCoV-2019.至于穿山甲是不是中間宿主，新冠病毒是蝙蝠&穿山甲病毒重組，還是怎么來(lái)的，現(xiàn)在下結(jié)論還有點(diǎn)早，不過(guò)這兩天的網(wǎng)上還真是眾說(shuō)紛紜.或許這種爭(zhēng)論會(huì)一直持續(xù)，直到出現(xiàn)新的力證......再聲明，預(yù)印本本身就是沒(méi)有經(jīng)過(guò)同行評(píng)議的，強(qiáng)調(diào)分享和開(kāi)放。這個(gè)沒(méi)有錯(cuò)誤，其所謂的觀點(diǎn)也屬于權(quán)威性不高，需要深入分析進(jìn)行分辨。（各個(gè)平臺(tái)和發(fā)布會(huì)也一樣）。
時(shí)間倉(cāng)促，個(gè)人愚見(jiàn)，如有不同觀點(diǎn)歡迎留言，有不同見(jiàn)解者請(qǐng)輕拍。
過(guò)往推文
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1、新科學(xué)研究發(fā)現(xiàn)：穿山甲是新冠病毒的潛在中間宿主有新證據(jù)，澎湃新聞。
2、華農(nóng)：穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主，相似度達(dá)99%。
3、Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in
2 southern China。
4、Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) ?
5、Isolation and Characterization of 2019-nCoV-like Coronavirus from Malayan
Pangolins。
6、Pangolin homology associated with 2019-nCoV。
7、Zhou, P., Yang, X., Wang, X. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature (2020)https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7。
8、Menachery, V., Yount, B., Debbink, K. et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nat Med 21, 1508–1513 (2015). https://doi.org/10.1038/nm.3985。
